{
  "_id": "6a1af39e1d7bb097a09f8595",
  "Package": "TIN",
  "Type": "Package",
  "Title": "Transcriptome instability analysis",
  "Version": "1.45.0",
  "Date": "2014-07-14",
  "Author": "Bjarne Johannessen, Anita Sveen and Rolf I. Skotheim",
  "Maintainer": "Bjarne Johannessen <bjajoh@rr-research.no>",
  "VignetteBuilder": "knitr",
  "biocViews": "ExonArray, Microarray, GeneExpression, AlternativeSplicing,\nGenetics, DifferentialSplicing",
  "Description": "The TIN package implements a set of tools for\ntranscriptome instability analysis based on exon expression\nprofiles. Deviating exon usage is studied in the context of\nsplicing factors to analyse to what degree transcriptome\ninstability is correlated to splicing factor expression. In the\ntranscriptome instability correlation analysis, the data is\ncompared to both random permutations of alternative splicing\nscores and expression of random gene sets.",
  "License": "Artistic-2.0",
  "Config/pak/sysreqs": "cmake make libicu-dev libuv1-dev",
  "Repository": "https://bioc.r-universe.dev",
  "Date/Publication": "2026-04-28 12:40:52 UTC",
  "RemoteUrl": "https://github.com/bioc/TIN",
  "RemoteRef": "HEAD",
  "RemoteSha": "9c84b8e0f2c467004f617c2dc6a0f917c7f4c5aa",
  "NeedsCompilation": "no",
  "Packaged": {
    "Date": "2026-05-30 09:45:17 UTC",
    "User": "root"
  },
  "MD5sum": "5a6dfa1215f3e5f65005cff9880dda47",
  "_user": "bioc",
  "_type": "src",
  "_file": "TIN_1.45.0.tar.gz",
  "_fileid": "c494cb6b84762c46005176572185b4e69a0a90679192ea6e0577bb1070c5fec0",
  "_filesize": 4931031,
  "_sha256": "c494cb6b84762c46005176572185b4e69a0a90679192ea6e0577bb1070c5fec0",
  "_created": "2026-05-30T09:45:17.000Z",
  "_published": "2026-05-30T14:26:38.965Z",
  "_jobs": [
    {
      "job": 78640533760,
      "time": 237,
      "config": "bioc-checks",
      "r": "4.6.0",
      "check": "ERROR",
      "artifact": "7307464679"
    },
    {
      "job": 78640533778,
      "time": 231,
      "config": "linux-devel-x86_64",
      "r": "4.7.0",
      "check": "NOTE",
      "artifact": "7307463668"
    },
    {
      "job": 78640533771,
      "time": 284,
      "config": "linux-release-x86_64",
      "r": "4.6.0",
      "check": "NOTE",
      "artifact": "7307468406"
    },
    {
      "job": 78640533779,
      "time": 122,
      "config": "macos-oldrel-arm64",
      "r": "4.5.3",
      "check": "NOTE",
      "artifact": "7308853688"
    },
    {
      "job": 78640533769,
      "time": 143,
      "config": "macos-release-arm64",
      "r": "4.6.0",
      "check": "NOTE",
      "artifact": "7308856918"
    },
    {
      "job": 78639818324,
      "time": 271,
      "config": "source",
      "r": "4.6.0",
      "check": "OK",
      "artifact": "7307279333"
    },
    {
      "job": 78640533764,
      "time": 202,
      "config": "wasm-release",
      "r": "4.6.0",
      "check": "OK",
      "artifact": "7307461778"
    },
    {
      "job": 78640533765,
      "time": 163,
      "config": "windows-devel",
      "r": "4.7.0",
      "check": "NOTE",
      "artifact": "7307458325"
    },
    {
      "job": 78640533766,
      "time": 151,
      "config": "windows-oldrel",
      "r": "4.5.3",
      "check": "NOTE",
      "artifact": "7307457909"
    },
    {
      "job": 78640533772,
      "time": 158,
      "config": "windows-release",
      "r": "4.6.0",
      "check": "NOTE",
      "artifact": "7307458568"
    }
  ],
  "_bioccheck": {
    "error": 1,
    "warning": 2,
    "note": 9
  },
  "_buildurl": "https://github.com/r-universe/bioc/actions/runs/26676723616",
  "_status": "success",
  "_host": "GitHub-Actions",
  "_upstream": "https://github.com/bioc/TIN",
  "_commit": {
    "id": "9c84b8e0f2c467004f617c2dc6a0f917c7f4c5aa",
    "author": "A Wokaty <andres.wokaty@sph.cuny.edu>",
    "committer": "A Wokaty <andres.wokaty@sph.cuny.edu>",
    "message": "bump x.y.z version to odd y following creation of RELEASE_3_23 branch\n",
    "time": 1777380052
  },
  "_maintainer": {
    "name": "Bjarne Johannessen",
    "email": "bjajoh@rr-research.no"
  },
  "_distro": "noble",
  "_registered": true,
  "_dependencies": [
    {
      "package": "R",
      "version": ">= 2.12.0",
      "role": "Depends"
    },
    {
      "package": "data.table",
      "role": "Depends"
    },
    {
      "package": "impute",
      "role": "Depends"
    },
    {
      "package": "aroma.affymetrix",
      "role": "Depends"
    },
    {
      "package": "WGCNA",
      "role": "Imports"
    },
    {
      "package": "squash",
      "role": "Imports"
    },
    {
      "package": "stringr",
      "role": "Imports"
    },
    {
      "package": "knitr",
      "role": "Suggests"
    },
    {
      "package": "aroma.light",
      "role": "Suggests"
    },
    {
      "package": "affxparser",
      "role": "Suggests"
    },
    {
      "package": "RUnit",
      "role": "Suggests"
    },
    {
      "package": "BiocGenerics",
      "role": "Suggests"
    }
  ],
  "_owner": "bioc",
  "_selfowned": true,
  "_usedby": 0,
  "_updates": [
    {
      "week": "2025-44",
      "n": 2
    },
    {
      "week": "2026-18",
      "n": 2
    }
  ],
  "_tags": [],
  "_bioc": [
    {
      "branch": "devel",
      "version": "1.45.0",
      "bioc": "3.24"
    },
    {
      "branch": "release",
      "version": "1.44.0",
      "bioc": "3.23"
    }
  ],
  "_topics": [
    "exonarray",
    "microarray",
    "geneexpression",
    "alternativesplicing",
    "genetics",
    "differentialsplicing"
  ],
  "_userbio": {
    "uuid": 2286807,
    "type": "organization",
    "name": "Bioconductor",
    "description": "Software for the analysis and comprehension of high-throughput genomic data"
  },
  "_downloads": {
    "count": 473,
    "source": "https://www.bioconductor.org/packages/stats/bioc/TIN"
  },
  "_mentions": 12,
  "_searchresults": 10,
  "_rbuild": "4.6.0",
  "_assets": [
    "extra/citation.cff",
    "extra/citation.html",
    "extra/citation.json",
    "extra/citation.txt",
    "extra/contents.json",
    "extra/NEWS.html",
    "extra/NEWS.txt",
    "extra/TIN.html",
    "manual.pdf"
  ],
  "_realowner": "bioc",
  "_cranurl": false,
  "_exports": [
    "aberrantExonUsage",
    "clusterPlot",
    "correlation",
    "correlationPlot",
    "firmaAnalysis",
    "geneSetCorrelation",
    "posNegCorrPlot",
    "probesetPermutations",
    "readGeneSummaries",
    "scatterPlot"
  ],
  "_datasets": [
    {
      "name": "geneAnnotation",
      "title": "geneAnnotation",
      "object": "geneAnnotation",
      "file": "geneAnnotation.rda",
      "class": [
        "data.frame"
      ],
      "fields": [
        "Transcript_cluster",
        "Gene_symbol"
      ],
      "rows": 22011,
      "table": true,
      "tojson": true
    },
    {
      "name": "geneSets",
      "title": "geneSets",
      "object": "geneSets",
      "file": "geneSets.rda",
      "class": [
        "data.frame"
      ],
      "fields": [
        "X1",
        "X2",
        "X3",
        "X4",
        "X5",
        "X6",
        "X7",
        "X8",
        "X9",
        "X10",
        "X11",
        "X12",
        "X13",
        "X14",
        "X15",
        "X16",
        "X17",
        "X18",
        "X19",
        "X20",
        "X21",
        "X22",
        "X23",
        "X24",
        "X25",
        "X26",
        "X27",
        "X28",
        "X29",
        "X30",
        "X31",
        "X32",
        "X33",
        "X34",
        "X35",
        "X36",
        "X37",
        "X38",
        "X39",
        "X40",
        "X41",
        "X42",
        "X43",
        "X44",
        "X45",
        "X46",
        "X47",
        "X48",
        "X49",
        "X50",
        "X51",
        "X52",
        "X53",
        "X54",
        "X55",
        "X56",
        "X57",
        "X58",
        "X59",
        "X60",
        "X61",
        "X62",
        "X63",
        "X64",
        "X65",
        "X66",
        "X67",
        "X68",
        "X69",
        "X70",
        "X71",
        "X72",
        "X73",
        "X74",
        "X75",
        "X76",
        "X77",
        "X78",
        "X79",
        "X80",
        "X81",
        "X82",
        "X83",
        "X84",
        "X85",
        "X86",
        "X87",
        "X88",
        "X89",
        "X90",
        "X91",
        "X92",
        "X93",
        "X94",
        "X95",
        "X96",
        "X97",
        "X98",
        "X99",
        "X100",
        "X101",
        "X102",
        "X103",
        "X104",
        "X105",
        "X106",
        "X107",
        "X108",
        "X109",
        "X110",
        "X111",
        "X112",
        "X113",
        "X114",
        "X115",
        "X116",
        "X117",
        "X118",
        "X119",
        "X120",
        "X121",
        "X122",
        "X123",
        "X124",
        "X125",
        "X126",
        "X127",
        "X128",
        "X129",
        "X130",
        "X131",
        "X132",
        "X133",
        "X134",
        "X135",
        "X136",
        "X137",
        "X138",
        "X139",
        "X140",
        "X141",
        "X142",
        "X143",
        "X144",
        "X145",
        "X146",
        "X147",
        "X148",
        "X149",
        "X150",
        "X151",
        "X152",
        "X153",
        "X154",
        "X155",
        "X156",
        "X157",
        "X158",
        "X159",
        "X160",
        "X161",
        "X162",
        "X163",
        "X164",
        "X165",
        "X166",
        "X167",
        "X168",
        "X169",
        "X170",
        "X171",
        "X172",
        "X173",
        "X174",
        "X175",
        "X176",
        "X177",
        "X178",
        "X179",
        "X180",
        "X181",
        "X182",
        "X183",
        "X184",
        "X185",
        "X186",
        "X187",
        "X188",
        "X189",
        "X190",
        "X191",
        "X192",
        "X193",
        "X194",
        "X195",
        "X196",
        "X197",
        "X198",
        "X199",
        "X200",
        "X201",
        "X202",
        "X203",
        "X204",
        "X205",
        "X206",
        "X207",
        "X208",
        "X209",
        "X210",
        "X211",
        "X212",
        "X213",
        "X214",
        "X215",
        "X216",
        "X217",
        "X218",
        "X219",
        "X220",
        "X221",
        "X222",
        "X223",
        "X224",
        "X225",
        "X226",
        "X227",
        "X228",
        "X229",
        "X230",
        "X231",
        "X232",
        "X233",
        "X234",
        "X235",
        "X236",
        "X237",
        "X238",
        "X239",
        "X240",
        "X241",
        "X242",
        "X243",
        "X244",
        "X245",
        "X246",
        "X247",
        "X248",
        "X249",
        "X250",
        "X251",
        "X252",
        "X253",
        "X254",
        "X255",
        "X256",
        "X257",
        "X258",
        "X259",
        "X260",
        "X261",
        "X262",
        "X263",
        "X264",
        "X265",
        "X266",
        "X267",
        "X268",
        "X269",
        "X270",
        "X271",
        "X272",
        "X273",
        "X274",
        "X275",
        "X276",
        "X277",
        "X278",
        "X279",
        "X280",
        "X281",
        "X282",
        "X283",
        "X284",
        "X285",
        "X286",
        "X287",
        "X288",
        "X289",
        "X290",
        "X291",
        "X292",
        "X293",
        "X294",
        "X295",
        "X296",
        "X297",
        "X298",
        "X299",
        "X300",
        "X301",
        "X302",
        "X303",
        "X304",
        "X305",
        "X306",
        "X307",
        "X308",
        "X309",
        "X310",
        "X311",
        "X312",
        "X313",
        "X314",
        "X315",
        "X316",
        "X317",
        "X318",
        "X319",
        "X320",
        "X321",
        "X322",
        "X323",
        "X324",
        "X325",
        "X326",
        "X327",
        "X328",
        "X329",
        "X330",
        "X331",
        "X332",
        "X333",
        "X334",
        "X335",
        "X336",
        "X337",
        "X338",
        "X339",
        "X340",
        "X341",
        "X342",
        "X343",
        "X344",
        "X345",
        "X346",
        "X347",
        "X348",
        "X349",
        "X350",
        "X351",
        "X352",
        "X353",
        "X354",
        "X355",
        "X356",
        "X357",
        "X358",
        "X359",
        "X360",
        "X361",
        "X362",
        "X363",
        "X364",
        "X365",
        "X366",
        "X367",
        "X368",
        "X369",
        "X370",
        "X371",
        "X372",
        "X373",
        "X374",
        "X375",
        "X376",
        "X377",
        "X378",
        "X379",
        "X380",
        "X381",
        "X382",
        "X383",
        "X384",
        "X385",
        "X386",
        "X387",
        "X388",
        "X389",
        "X390",
        "X391",
        "X392",
        "X393",
        "X394",
        "X395",
        "X396",
        "X397",
        "X398",
        "X399",
        "X400",
        "X401",
        "X402",
        "X403",
        "X404",
        "X405",
        "X406",
        "X407",
        "X408",
        "X409",
        "X410",
        "X411",
        "X412",
        "X413",
        "X414",
        "X415",
        "X416",
        "X417",
        "X418",
        "X419",
        "X420",
        "X421",
        "X422",
        "X423",
        "X424",
        "X425",
        "X426",
        "X427",
        "X428",
        "X429",
        "X430",
        "X431",
        "X432",
        "X433",
        "X434",
        "X435",
        "X436",
        "X437",
        "X438",
        "X439",
        "X440",
        "X441",
        "X442",
        "X443",
        "X444",
        "X445",
        "X446",
        "X447",
        "X448",
        "X449",
        "X450",
        "X451",
        "X452",
        "X453",
        "X454",
        "X455",
        "X456",
        "X457",
        "X458",
        "X459",
        "X460",
        "X461",
        "X462",
        "X463",
        "X464",
        "X465",
        "X466",
        "X467",
        "X468",
        "X469",
        "X470",
        "X471",
        "X472",
        "X473",
        "X474",
        "X475",
        "X476",
        "X477",
        "X478",
        "X479",
        "X480",
        "X481",
        "X482",
        "X483",
        "X484",
        "X485",
        "X486",
        "X487",
        "X488",
        "X489",
        "X490",
        "X491",
        "X492",
        "X493",
        "X494",
        "X495",
        "X496",
        "X497",
        "X498",
        "X499",
        "X500",
        "X501",
        "X502",
        "X503",
        "X504",
        "X505",
        "X506",
        "X507",
        "X508",
        "X509",
        "X510",
        "X511",
        "X512",
        "X513",
        "X514",
        "X515",
        "X516",
        "X517",
        "X518",
        "X519",
        "X520",
        "X521",
        "X522",
        "X523",
        "X524",
        "X525",
        "X526",
        "X527",
        "X528",
        "X529",
        "X530",
        "X531",
        "X532",
        "X533",
        "X534",
        "X535",
        "X536",
        "X537",
        "X538",
        "X539",
        "X540",
        "X541",
        "X542",
        "X543",
        "X544",
        "X545",
        "X546",
        "X547",
        "X548",
        "X549",
        "X550",
        "X551",
        "X552",
        "X553",
        "X554",
        "X555",
        "X556",
        "X557",
        "X558",
        "X559",
        "X560",
        "X561",
        "X562",
        "X563",
        "X564",
        "X565",
        "X566",
        "X567",
        "X568",
        "X569",
        "X570",
        "X571",
        "X572",
        "X573",
        "X574",
        "X575",
        "X576",
        "X577",
        "X578",
        "X579",
        "X580",
        "X581",
        "X582",
        "X583",
        "X584",
        "X585",
        "X586",
        "X587",
        "X588",
        "X589",
        "X590",
        "X591",
        "X592",
        "X593",
        "X594",
        "X595",
        "X596",
        "X597",
        "X598",
        "X599",
        "X600",
        "X601",
        "X602",
        "X603",
        "X604",
        "X605",
        "X606",
        "X607",
        "X608",
        "X609",
        "X610",
        "X611",
        "X612",
        "X613",
        "X614",
        "X615",
        "X616",
        "X617",
        "X618",
        "X619",
        "X620",
        "X621",
        "X622",
        "X623",
        "X624",
        "X625",
        "X626",
        "X627",
        "X628",
        "X629",
        "X630",
        "X631",
        "X632",
        "X633",
        "X634",
        "X635",
        "X636",
        "X637",
        "X638",
        "X639",
        "X640",
        "X641",
        "X642",
        "X643",
        "X644",
        "X645",
        "X646",
        "X647",
        "X648",
        "X649",
        "X650",
        "X651",
        "X652",
        "X653",
        "X654",
        "X655",
        "X656",
        "X657",
        "X658",
        "X659",
        "X660",
        "X661",
        "X662",
        "X663",
        "X664",
        "X665",
        "X666",
        "X667",
        "X668",
        "X669",
        "X670",
        "X671",
        "X672",
        "X673",
        "X674",
        "X675",
        "X676",
        "X677",
        "X678",
        "X679",
        "X680",
        "X681",
        "X682",
        "X683",
        "X684",
        "X685",
        "X686",
        "X687",
        "X688",
        "X689",
        "X690",
        "X691",
        "X692",
        "X693",
        "X694",
        "X695",
        "X696",
        "X697",
        "X698",
        "X699",
        "X700",
        "X701",
        "X702",
        "X703",
        "X704",
        "X705",
        "X706",
        "X707",
        "X708",
        "X709",
        "X710",
        "X711",
        "X712",
        "X713",
        "X714",
        "X715",
        "X716",
        "X717",
        "X718",
        "X719",
        "X720",
        "X721",
        "X722",
        "X723",
        "X724",
        "X725",
        "X726",
        "X727",
        "X728",
        "X729",
        "X730",
        "X731",
        "X732",
        "X733",
        "X734",
        "X735",
        "X736",
        "X737",
        "X738",
        "X739",
        "X740",
        "X741",
        "X742",
        "X743",
        "X744",
        "X745",
        "X746",
        "X747",
        "X748",
        "X749",
        "X750",
        "X751",
        "X752",
        "X753",
        "X754",
        "X755",
        "X756",
        "X757",
        "X758",
        "X759",
        "X760",
        "X761",
        "X762",
        "X763",
        "X764",
        "X765",
        "X766",
        "X767",
        "X768",
        "X769",
        "X770",
        "X771",
        "X772",
        "X773",
        "X774",
        "X775",
        "X776",
        "X777",
        "X778",
        "X779",
        "X780",
        "X781",
        "X782",
        "X783",
        "X784",
        "X785",
        "X786",
        "X787",
        "X788",
        "X789",
        "X790",
        "X791",
        "X792",
        "X793",
        "X794",
        "X795",
        "X796",
        "X797",
        "X798",
        "X799",
        "X800",
        "X801",
        "X802",
        "X803",
        "X804",
        "X805",
        "X806",
        "X807",
        "X808",
        "X809",
        "X810",
        "X811",
        "X812",
        "X813",
        "X814",
        "X815",
        "X816",
        "X817",
        "X818",
        "X819",
        "X820",
        "X821",
        "X822",
        "X823",
        "X824",
        "X825",
        "X826",
        "X827",
        "X828",
        "X829",
        "X830",
        "X831",
        "X832",
        "X833",
        "X834",
        "X835",
        "X836",
        "X837",
        "X838",
        "X839",
        "X840",
        "X841",
        "X842",
        "X843",
        "X844",
        "X845",
        "X846",
        "X847",
        "X848",
        "X849",
        "X850",
        "X851",
        "X852",
        "X853",
        "X854",
        "X855",
        "X856",
        "X857",
        "X858",
        "X859",
        "X860",
        "X861",
        "X862",
        "X863",
        "X864",
        "X865",
        "X866",
        "X867",
        "X868",
        "X869",
        "X870",
        "X871",
        "X872",
        "X873",
        "X874",
        "X875",
        "X876",
        "X877",
        "X878",
        "X879",
        "X880",
        "X881",
        "X882",
        "X883",
        "X884",
        "X885",
        "X886",
        "X887",
        "X888",
        "X889",
        "X890",
        "X891",
        "X892",
        "X893",
        "X894",
        "X895",
        "X896",
        "X897",
        "X898",
        "X899",
        "X900",
        "X901",
        "X902",
        "X903",
        "X904",
        "X905",
        "X906",
        "X907",
        "X908",
        "X909",
        "X910",
        "X911",
        "X912",
        "X913",
        "X914",
        "X915",
        "X916",
        "X917",
        "X918",
        "X919",
        "X920",
        "X921",
        "X922",
        "X923",
        "X924",
        "X925",
        "X926",
        "X927",
        "X928",
        "X929",
        "X930",
        "X931",
        "X932",
        "X933",
        "X934",
        "X935",
        "X936",
        "X937",
        "X938",
        "X939",
        "X940",
        "X941",
        "X942",
        "X943",
        "X944",
        "X945",
        "X946",
        "X947",
        "X948",
        "X949",
        "X950",
        "X951",
        "X952",
        "X953",
        "X954",
        "X955",
        "X956",
        "X957",
        "X958",
        "X959",
        "X960",
        "X961",
        "X962",
        "X963",
        "X964",
        "X965",
        "X966",
        "X967",
        "X968",
        "X969",
        "X970",
        "X971",
        "X972",
        "X973",
        "X974",
        "X975",
        "X976",
        "X977",
        "X978",
        "X979",
        "X980",
        "X981",
        "X982",
        "X983",
        "X984",
        "X985",
        "X986",
        "X987",
        "X988",
        "X989",
        "X990",
        "X991",
        "X992",
        "X993",
        "X994",
        "X995",
        "X996",
        "X997",
        "X998",
        "X999",
        "X1000",
        "X1001",
        "X1002",
        "X1003",
        "X1004",
        "X1005",
        "X1006",
        "X1007",
        "X1008",
        "X1009",
        "X1010",
        "X1011",
        "X1012",
        "X1013",
        "X1014",
        "X1015",
        "X1016",
        "X1017",
        "X1018",
        "X1019",
        "X1020",
        "X1021",
        "X1022",
        "X1023",
        "X1024",
        "X1025",
        "X1026",
        "X1027",
        "X1028",
        "X1029",
        "X1030",
        "X1031",
        "X1032",
        "X1033",
        "X1034",
        "X1035",
        "X1036",
        "X1037",
        "X1038",
        "X1039",
        "X1040",
        "X1041",
        "X1042",
        "X1043",
        "X1044",
        "X1045",
        "X1046",
        "X1047",
        "X1048",
        "X1049",
        "X1050",
        "X1051",
        "X1052",
        "X1053",
        "X1054",
        "X1055",
        "X1056",
        "X1057",
        "X1058",
        "X1059",
        "X1060",
        "X1061",
        "X1062",
        "X1063",
        "X1064",
        "X1065",
        "X1066",
        "X1067",
        "X1068",
        "X1069",
        "X1070",
        "X1071",
        "X1072",
        "X1073",
        "X1074",
        "X1075",
        "X1076",
        "X1077",
        "X1078",
        "X1079",
        "X1080",
        "X1081",
        "X1082",
        "X1083",
        "X1084",
        "X1085",
        "X1086",
        "X1087",
        "X1088",
        "X1089",
        "X1090",
        "X1091",
        "X1092",
        "X1093",
        "X1094",
        "X1095",
        "X1096",
        "X1097",
        "X1098",
        "X1099",
        "X1100",
        "X1101",
        "X1102",
        "X1103",
        "X1104",
        "X1105",
        "X1106",
        "X1107",
        "X1108",
        "X1109",
        "X1110",
        "X1111",
        "X1112",
        "X1113",
        "X1114",
        "X1115",
        "X1116",
        "X1117",
        "X1118",
        "X1119",
        "X1120",
        "X1121",
        "X1122",
        "X1123",
        "X1124",
        "X1125",
        "X1126",
        "X1127",
        "X1128",
        "X1129",
        "X1130",
        "X1131",
        "X1132",
        "X1133",
        "X1134",
        "X1135",
        "X1136",
        "X1137",
        "X1138",
        "X1139",
        "X1140",
        "X1141",
        "X1142",
        "X1143",
        "X1144",
        "X1145",
        "X1146",
        "X1147",
        "X1148",
        "X1149",
        "X1150",
        "X1151",
        "X1152",
        "X1153",
        "X1154",
        "X1155",
        "X1156",
        "X1157",
        "X1158",
        "X1159",
        "X1160",
        "X1161",
        "X1162",
        "X1163",
        "X1164",
        "X1165",
        "X1166",
        "X1167",
        "X1168",
        "X1169",
        "X1170",
        "X1171",
        "X1172",
        "X1173",
        "X1174",
        "X1175",
        "X1176",
        "X1177",
        "X1178",
        "X1179",
        "X1180",
        "X1181",
        "X1182",
        "X1183",
        "X1184",
        "X1185",
        "X1186",
        "X1187",
        "X1188",
        "X1189",
        "X1190",
        "X1191",
        "X1192",
        "X1193",
        "X1194",
        "X1195",
        "X1196",
        "X1197",
        "X1198",
        "X1199",
        "X1200",
        "X1201",
        "X1202",
        "X1203",
        "X1204",
        "X1205",
        "X1206",
        "X1207",
        "X1208",
        "X1209",
        "X1210",
        "X1211",
        "X1212",
        "X1213",
        "X1214",
        "X1215",
        "X1216",
        "X1217",
        "X1218",
        "X1219",
        "X1220",
        "X1221",
        "X1222",
        "X1223",
        "X1224",
        "X1225",
        "X1226",
        "X1227",
        "X1228",
        "X1229",
        "X1230",
        "X1231",
        "X1232",
        "X1233",
        "X1234",
        "X1235",
        "X1236",
        "X1237",
        "X1238",
        "X1239",
        "X1240",
        "X1241",
        "X1242",
        "X1243",
        "X1244",
        "X1245",
        "X1246",
        "X1247",
        "X1248",
        "X1249",
        "X1250",
        "X1251",
        "X1252",
        "X1253",
        "X1254",
        "X1255",
        "X1256",
        "X1257",
        "X1258",
        "X1259",
        "X1260",
        "X1261",
        "X1262",
        "X1263",
        "X1264",
        "X1265",
        "X1266",
        "X1267",
        "X1268",
        "X1269",
        "X1270",
        "X1271",
        "X1272",
        "X1273",
        "X1274",
        "X1275",
        "X1276",
        "X1277",
        "X1278",
        "X1279",
        "X1280",
        "X1281",
        "X1282",
        "X1283",
        "X1284",
        "X1285",
        "X1286",
        "X1287",
        "X1288",
        "X1289",
        "X1290",
        "X1291",
        "X1292",
        "X1293",
        "X1294",
        "X1295",
        "X1296",
        "X1297",
        "X1298",
        "X1299",
        "X1300",
        "X1301",
        "X1302",
        "X1303",
        "X1304",
        "X1305",
        "X1306",
        "X1307",
        "X1308",
        "X1309",
        "X1310",
        "X1311",
        "X1312",
        "X1313",
        "X1314",
        "X1315",
        "X1316",
        "X1317",
        "X1318",
        "X1319",
        "X1320",
        "X1321",
        "X1322",
        "X1323",
        "X1324",
        "X1325",
        "X1326",
        "X1327",
        "X1328",
        "X1329",
        "X1330",
        "X1331",
        "X1332",
        "X1333",
        "X1334",
        "X1335",
        "X1336",
        "X1337",
        "X1338",
        "X1339",
        "X1340",
        "X1341",
        "X1342",
        "X1343",
        "X1344",
        "X1345",
        "X1346",
        "X1347",
        "X1348",
        "X1349",
        "X1350",
        "X1351",
        "X1352",
        "X1353",
        "X1354",
        "X1355",
        "X1356",
        "X1357",
        "X1358",
        "X1359",
        "X1360",
        "X1361",
        "X1362",
        "X1363",
        "X1364",
        "X1365",
        "X1366",
        "X1367",
        "X1368",
        "X1369",
        "X1370",
        "X1371",
        "X1372",
        "X1373",
        "X1374",
        "X1375",
        "X1376",
        "X1377",
        "X1378",
        "X1379",
        "X1380",
        "X1381",
        "X1382",
        "X1383",
        "X1384",
        "X1385",
        "X1386",
        "X1387",
        "X1388",
        "X1389",
        "X1390",
        "X1391",
        "X1392",
        "X1393",
        "X1394",
        "X1395",
        "X1396",
        "X1397",
        "X1398",
        "X1399",
        "X1400",
        "X1401",
        "X1402",
        "X1403",
        "X1404",
        "X1405",
        "X1406",
        "X1407",
        "X1408",
        "X1409",
        "X1410",
        "X1411",
        "X1412",
        "X1413",
        "X1414",
        "X1415",
        "X1416",
        "X1417",
        "X1418",
        "X1419",
        "X1420",
        "X1421",
        "X1422",
        "X1423",
        "X1424",
        "X1425",
        "X1426",
        "X1427",
        "X1428",
        "X1429",
        "X1430",
        "X1431",
        "X1432",
        "X1433",
        "X1434",
        "X1435",
        "X1436",
        "X1437",
        "X1438",
        "X1439",
        "X1440",
        "X1441",
        "X1442",
        "X1443",
        "X1444",
        "X1445",
        "X1446",
        "X1447",
        "X1448",
        "X1449",
        "X1450",
        "X1451",
        "X1452",
        "X1453",
        "X1454",
        "X1455",
        "X1456",
        "X1457",
        "X1458",
        "X1459",
        "X1460",
        "X1461",
        "X1462",
        "X1463",
        "X1464",
        "X1465",
        "X1466",
        "X1467",
        "X1468",
        "X1469",
        "X1470",
        "X1471",
        "X1472",
        "X1473",
        "X1474",
        "X1475",
        "X1476",
        "X1477",
        "X1478",
        "X1479",
        "X1480",
        "X1481",
        "X1482",
        "X1483",
        "X1484",
        "X1485",
        "X1486",
        "X1487",
        "X1488",
        "X1489",
        "X1490",
        "X1491",
        "X1492",
        "X1493",
        "X1494",
        "X1495",
        "X1496",
        "X1497",
        "X1498",
        "X1499",
        "X1500",
        "X1501",
        "X1502",
        "X1503",
        "X1504",
        "X1505",
        "X1506",
        "X1507",
        "X1508",
        "X1509",
        "X1510",
        "X1511",
        "X1512",
        "X1513",
        "X1514",
        "X1515",
        "X1516",
        "X1517",
        "X1518",
        "X1519",
        "X1520",
        "X1521",
        "X1522",
        "X1523",
        "X1524",
        "X1525",
        "X1526",
        "X1527",
        "X1528",
        "X1529",
        "X1530",
        "X1531",
        "X1532",
        "X1533",
        "X1534",
        "X1535",
        "X1536",
        "X1537",
        "X1538",
        "X1539",
        "X1540",
        "X1541",
        "X1542",
        "X1543",
        "X1544",
        "X1545",
        "X1546",
        "X1547",
        "X1548",
        "X1549",
        "X1550",
        "X1551",
        "X1552",
        "X1553",
        "X1554",
        "X1555",
        "X1556",
        "X1557",
        "X1558",
        "X1559",
        "X1560",
        "X1561",
        "X1562",
        "X1563",
        "X1564",
        "X1565",
        "X1566",
        "X1567",
        "X1568",
        "X1569",
        "X1570",
        "X1571",
        "X1572",
        "X1573",
        "X1574",
        "X1575",
        "X1576",
        "X1577",
        "X1578",
        "X1579",
        "X1580",
        "X1581",
        "X1582",
        "X1583",
        "X1584",
        "X1585",
        "X1586",
        "X1587",
        "X1588",
        "X1589",
        "X1590",
        "X1591",
        "X1592",
        "X1593",
        "X1594",
        "X1595",
        "X1596",
        "X1597",
        "X1598",
        "X1599",
        "X1600",
        "X1601",
        "X1602",
        "X1603",
        "X1604",
        "X1605",
        "X1606",
        "X1607",
        "X1608",
        "X1609",
        "X1610",
        "X1611",
        "X1612",
        "X1613",
        "X1614",
        "X1615",
        "X1616",
        "X1617",
        "X1618",
        "X1619",
        "X1620",
        "X1621",
        "X1622",
        "X1623",
        "X1624",
        "X1625",
        "X1626",
        "X1627",
        "X1628",
        "X1629",
        "X1630",
        "X1631",
        "X1632",
        "X1633",
        "X1634",
        "X1635",
        "X1636",
        "X1637",
        "X1638",
        "X1639",
        "X1640",
        "X1641",
        "X1642",
        "X1643",
        "X1644",
        "X1645",
        "X1646",
        "X1647",
        "X1648",
        "X1649",
        "X1650",
        "X1651",
        "X1652",
        "X1653",
        "X1654",
        "X1655",
        "X1656",
        "X1657",
        "X1658",
        "X1659",
        "X1660",
        "X1661",
        "X1662",
        "X1663",
        "X1664",
        "X1665",
        "X1666",
        "X1667",
        "X1668",
        "X1669",
        "X1670",
        "X1671",
        "X1672",
        "X1673",
        "X1674",
        "X1675",
        "X1676",
        "X1677",
        "X1678",
        "X1679",
        "X1680",
        "X1681",
        "X1682",
        "X1683",
        "X1684",
        "X1685",
        "X1686",
        "X1687",
        "X1688",
        "X1689",
        "X1690",
        "X1691",
        "X1692",
        "X1693",
        "X1694",
        "X1695",
        "X1696",
        "X1697",
        "X1698",
        "X1699",
        "X1700",
        "X1701",
        "X1702",
        "X1703",
        "X1704",
        "X1705",
        "X1706",
        "X1707",
        "X1708",
        "X1709",
        "X1710",
        "X1711",
        "X1712",
        "X1713",
        "X1714",
        "X1715",
        "X1716",
        "X1717",
        "X1718",
        "X1719",
        "X1720",
        "X1721",
        "X1722",
        "X1723",
        "X1724",
        "X1725",
        "X1726",
        "X1727",
        "X1728",
        "X1729",
        "X1730",
        "X1731",
        "X1732",
        "X1733",
        "X1734",
        "X1735",
        "X1736",
        "X1737",
        "X1738",
        "X1739",
        "X1740",
        "X1741",
        "X1742",
        "X1743",
        "X1744",
        "X1745",
        "X1746",
        "X1747",
        "X1748",
        "X1749",
        "X1750",
        "X1751",
        "X1752",
        "X1753",
        "X1754",
        "X1755",
        "X1756",
        "X1757",
        "X1758",
        "X1759",
        "X1760",
        "X1761",
        "X1762",
        "X1763",
        "X1764",
        "X1765",
        "X1766",
        "X1767",
        "X1768",
        "X1769",
        "X1770",
        "X1771",
        "X1772",
        "X1773",
        "X1774",
        "X1775",
        "X1776",
        "X1777",
        "X1778",
        "X1779",
        "X1780",
        "X1781",
        "X1782",
        "X1783",
        "X1784",
        "X1785",
        "X1786",
        "X1787",
        "X1788",
        "X1789",
        "X1790",
        "X1791",
        "X1792",
        "X1793",
        "X1794",
        "X1795",
        "X1796",
        "X1797",
        "X1798",
        "X1799",
        "X1800",
        "X1801",
        "X1802",
        "X1803",
        "X1804",
        "X1805",
        "X1806",
        "X1807",
        "X1808",
        "X1809",
        "X1810",
        "X1811",
        "X1812",
        "X1813",
        "X1814",
        "X1815",
        "X1816",
        "X1817",
        "X1818",
        "X1819",
        "X1820",
        "X1821",
        "X1822",
        "X1823",
        "X1824",
        "X1825",
        "X1826",
        "X1827",
        "X1828",
        "X1829",
        "X1830",
        "X1831",
        "X1832",
        "X1833",
        "X1834",
        "X1835",
        "X1836",
        "X1837",
        "X1838",
        "X1839",
        "X1840",
        "X1841",
        "X1842",
        "X1843",
        "X1844",
        "X1845",
        "X1846",
        "X1847",
        "X1848",
        "X1849",
        "X1850",
        "X1851",
        "X1852",
        "X1853",
        "X1854",
        "X1855",
        "X1856",
        "X1857",
        "X1858",
        "X1859",
        "X1860",
        "X1861",
        "X1862",
        "X1863",
        "X1864",
        "X1865",
        "X1866",
        "X1867",
        "X1868",
        "X1869",
        "X1870",
        "X1871",
        "X1872",
        "X1873",
        "X1874",
        "X1875",
        "X1876",
        "X1877",
        "X1878",
        "X1879",
        "X1880",
        "X1881",
        "X1882",
        "X1883",
        "X1884",
        "X1885",
        "X1886",
        "X1887",
        "X1888",
        "X1889",
        "X1890",
        "X1891",
        "X1892",
        "X1893",
        "X1894",
        "X1895",
        "X1896",
        "X1897",
        "X1898",
        "X1899",
        "X1900",
        "X1901",
        "X1902",
        "X1903",
        "X1904",
        "X1905",
        "X1906",
        "X1907",
        "X1908",
        "X1909",
        "X1910",
        "X1911",
        "X1912",
        "X1913",
        "X1914",
        "X1915",
        "X1916",
        "X1917",
        "X1918",
        "X1919",
        "X1920",
        "X1921",
        "X1922",
        "X1923",
        "X1924",
        "X1925",
        "X1926",
        "X1927",
        "X1928",
        "X1929",
        "X1930",
        "X1931",
        "X1932",
        "X1933",
        "X1934",
        "X1935",
        "X1936",
        "X1937",
        "X1938",
        "X1939",
        "X1940",
        "X1941",
        "X1942",
        "X1943",
        "X1944",
        "X1945",
        "X1946",
        "X1947",
        "X1948",
        "X1949",
        "X1950",
        "X1951",
        "X1952",
        "X1953",
        "X1954",
        "X1955",
        "X1956",
        "X1957",
        "X1958",
        "X1959",
        "X1960",
        "X1961",
        "X1962",
        "X1963",
        "X1964",
        "X1965",
        "X1966",
        "X1967",
        "X1968",
        "X1969",
        "X1970",
        "X1971",
        "X1972",
        "X1973",
        "X1974",
        "X1975",
        "X1976",
        "X1977",
        "X1978",
        "X1979",
        "X1980",
        "X1981",
        "X1982",
        "X1983",
        "X1984",
        "X1985",
        "X1986",
        "X1987",
        "X1988",
        "X1989",
        "X1990",
        "X1991",
        "X1992",
        "X1993",
        "X1994",
        "X1995",
        "X1996",
        "X1997",
        "X1998",
        "X1999",
        "X2000",
        "X2001",
        "X2002",
        "X2003",
        "X2004",
        "X2005",
        "X2006",
        "X2007",
        "X2008",
        "X2009",
        "X2010",
        "X2011",
        "X2012",
        "X2013",
        "X2014",
        "X2015",
        "X2016",
        "X2017",
        "X2018",
        "X2019",
        "X2020",
        "X2021",
        "X2022",
        "X2023",
        "X2024",
        "X2025",
        "X2026",
        "X2027",
        "X2028",
        "X2029",
        "X2030",
        "X2031",
        "X2032",
        "X2033",
        "X2034",
        "X2035",
        "X2036",
        "X2037",
        "X2038",
        "X2039",
        "X2040",
        "X2041",
        "X2042",
        "X2043",
        "X2044",
        "X2045",
        "X2046",
        "X2047",
        "X2048",
        "X2049",
        "X2050",
        "X2051",
        "X2052",
        "X2053",
        "X2054",
        "X2055",
        "X2056",
        "X2057",
        "X2058",
        "X2059",
        "X2060",
        "X2061",
        "X2062",
        "X2063",
        "X2064",
        "X2065",
        "X2066",
        "X2067",
        "X2068",
        "X2069",
        "X2070",
        "X2071",
        "X2072",
        "X2073",
        "X2074",
        "X2075",
        "X2076",
        "X2077",
        "X2078",
        "X2079",
        "X2080",
        "X2081",
        "X2082",
        "X2083",
        "X2084",
        "X2085",
        "X2086",
        "X2087",
        "X2088",
        "X2089",
        "X2090",
        "X2091",
        "X2092",
        "X2093",
        "X2094",
        "X2095",
        "X2096",
        "X2097",
        "X2098",
        "X2099",
        "X2100",
        "X2101",
        "X2102",
        "X2103",
        "X2104",
        "X2105",
        "X2106",
        "X2107",
        "X2108",
        "X2109",
        "X2110",
        "X2111",
        "X2112",
        "X2113",
        "X2114",
        "X2115",
        "X2116",
        "X2117",
        "X2118",
        "X2119",
        "X2120",
        "X2121",
        "X2122",
        "X2123",
        "X2124",
        "X2125",
        "X2126",
        "X2127",
        "X2128",
        "X2129",
        "X2130",
        "X2131",
        "X2132",
        "X2133"
      ],
      "rows": 1454,
      "table": true,
      "tojson": true
    },
    {
      "name": "sampleSetFirmaScores",
      "title": "sampleSetFirmaScores",
      "object": "sampleSetFirmaScores",
      "file": "sampleSetFirmaScores.rda",
      "class": [
        "data.frame"
      ],
      "fields": [
        "GSM526134_YX_Exon1_PCA0001",
        "GSM526135_YX_Exon1_PCA0002",
        "GSM526136_YX_Exon1_PCA0003",
        "GSM526137_YX_Exon1_PCA0005",
        "GSM526138_YX_Exon1_PCA0007",
        "GSM526139_YX_Exon1_PCA0008",
        "GSM526140_YX_Exon1_PCA0009",
        "GSM526141_YX_Exon1_PCA0010",
        "GSM526142_YX_Exon1_PCA0011",
        "GSM526143_YX_Exon1_PCA0012",
        "GSM526144_YX_Exon1_PCA0013",
        "GSM526145_YX_Exon1_PCA0014",
        "GSM526146_YX_Exon1_PCA0015",
        "GSM526147_YX_Exon1_PCA0017",
        "GSM526148_YX_Exon1_PCA0018",
        "GSM526149_YX_Exon1_PCA0020"
      ],
      "rows": 10000,
      "table": true,
      "tojson": true
    },
    {
      "name": "sampleSetGeneSummaries",
      "title": "sampleSetGeneSummaries",
      "object": "sampleSetGeneSummaries",
      "file": "sampleSetGeneSummaries.rda",
      "class": [
        "data.frame"
      ],
      "fields": [
        "GSM526134_YX_Exon1_PCA0001.rma.gene.core.Signal",
        "GSM526135_YX_Exon1_PCA0002.rma.gene.core.Signal",
        "GSM526136_YX_Exon1_PCA0003.rma.gene.core.Signal",
        "GSM526137_YX_Exon1_PCA0005.rma.gene.core.Signal",
        "GSM526138_YX_Exon1_PCA0007.rma.gene.core.Signal",
        "GSM526139_YX_Exon1_PCA0008.rma.gene.core.Signal",
        "GSM526140_YX_Exon1_PCA0009.rma.gene.core.Signal",
        "GSM526141_YX_Exon1_PCA0010.rma.gene.core.Signal",
        "GSM526142_YX_Exon1_PCA0011.rma.gene.core.Signal",
        "GSM526143_YX_Exon1_PCA0012.rma.gene.core.Signal",
        "GSM526144_YX_Exon1_PCA0013.rma.gene.core.Signal",
        "GSM526145_YX_Exon1_PCA0014.rma.gene.core.Signal",
        "GSM526146_YX_Exon1_PCA0015.rma.gene.core.Signal",
        "GSM526147_YX_Exon1_PCA0017.rma.gene.core.Signal",
        "GSM526148_YX_Exon1_PCA0018.rma.gene.core.Signal",
        "GSM526149_YX_Exon1_PCA0020.rma.gene.core.Signal"
      ],
      "rows": 22011,
      "table": true,
      "tojson": true
    },
    {
      "name": "splicingFactors",
      "title": "A list of 280 splicing factor genes",
      "object": "splicingFactors",
      "file": "splicingFactors.rda",
      "class": [
        "data.frame"
      ],
      "fields": [
        "transcript_cluster_id",
        "GeneSymbol"
      ],
      "rows": 280,
      "table": true,
      "tojson": true
    }
  ],
  "_help": [
    {
      "page": "aberrantExonUsage",
      "title": "Calculations of relative aberrant exon usage amounts per sample (based on FIRMA scores)",
      "topics": [
        "aberrantExonUsage"
      ]
    },
    {
      "page": "clusterPlot",
      "title": "clusterPlot",
      "topics": [
        "clusterPlot"
      ]
    },
    {
      "page": "correlation",
      "title": "Calculates the correlation between sample-wise amounts of aberrant exon usage and splicing factor expression levels",
      "topics": [
        "correlation"
      ]
    },
    {
      "page": "correlationPlot",
      "title": "correlationPlot",
      "topics": [
        "correlationPlot"
      ]
    },
    {
      "page": "firmaAnalysis",
      "title": "Read CEL files and perform FIRMA analysis",
      "topics": [
        "firmaAnalysis"
      ]
    },
    {
      "page": "geneAnnotation",
      "title": "geneAnnotation",
      "topics": [
        "geneAnnotation"
      ]
    },
    {
      "page": "geneSetCorrelation",
      "title": "Correlation between aberrant exon usage and expression levels for a number of gene sets.",
      "topics": [
        "geneSetCorrelation"
      ]
    },
    {
      "page": "geneSets",
      "title": "geneSets",
      "topics": [
        "geneSets"
      ]
    },
    {
      "page": "posNegCorrPlot",
      "title": "posNegCorrPlot",
      "topics": [
        "posNegCorrPlot"
      ]
    },
    {
      "page": "probesetPermutations",
      "title": "Permutations of the samples at each probeset",
      "topics": [
        "probesetPermutations"
      ]
    },
    {
      "page": "readGeneSummaries",
      "title": "Read gene-level expression summaries",
      "topics": [
        "readGeneSummaries"
      ]
    },
    {
      "page": "sampleSetFirmaScores",
      "title": "sampleSetFirmaScores",
      "topics": [
        "sampleSetFirmaScores"
      ]
    },
    {
      "page": "sampleSetGeneSummaries",
      "title": "sampleSetGeneSummaries",
      "topics": [
        "sampleSetGeneSummaries"
      ]
    },
    {
      "page": "scatterPlot",
      "title": "Scatterplot showing relative amounts of aberrant exon usage per sample",
      "topics": [
        "scatterPlot"
      ]
    },
    {
      "page": "splicingFactors",
      "title": "A list of 280 splicing factor genes",
      "topics": [
        "splicingFactors"
      ]
    }
  ],
  "_rundeps": [
    "aroma.affymetrix",
    "aroma.apd",
    "aroma.core",
    "aroma.light",
    "backports",
    "base64enc",
    "BiocManager",
    "bslib",
    "cachem",
    "checkmate",
    "cli",
    "cluster",
    "codetools",
    "colorspace",
    "cpp11",
    "data.table",
    "digest",
    "DNAcopy",
    "doParallel",
    "dynamicTreeCut",
    "evaluate",
    "farver",
    "fastcluster",
    "fastmap",
    "fontawesome",
    "foreach",
    "foreign",
    "Formula",
    "fs",
    "future",
    "ggplot2",
    "globals",
    "glue",
    "gridExtra",
    "gtable",
    "highr",
    "Hmisc",
    "htmlTable",
    "htmltools",
    "htmlwidgets",
    "impute",
    "isoband",
    "iterators",
    "jquerylib",
    "jsonlite",
    "knitr",
    "labeling",
    "lattice",
    "lifecycle",
    "listenv",
    "magrittr",
    "MASS",
    "Matrix",
    "matrixStats",
    "memoise",
    "mime",
    "nnet",
    "parallelly",
    "preprocessCore",
    "PSCBS",
    "R.cache",
    "R.devices",
    "R.filesets",
    "R.huge",
    "R.methodsS3",
    "R.oo",
    "R.rsp",
    "R.utils",
    "R6",
    "rappdirs",
    "RColorBrewer",
    "Rcpp",
    "rlang",
    "rmarkdown",
    "rpart",
    "rstudioapi",
    "S7",
    "sass",
    "scales",
    "squash",
    "stringi",
    "stringr",
    "survival",
    "tinytex",
    "vctrs",
    "viridisLite",
    "WGCNA",
    "withr",
    "xfun",
    "yaml"
  ],
  "_vignettes": [
    {
      "source": "TIN.Rnw",
      "filename": "TIN.pdf",
      "title": "Introduction to the TIN package",
      "engine": "utils::Sweave",
      "headings": [],
      "created": "2015-03-20 17:13:09",
      "modified": "2015-03-20 17:13:09",
      "commits": 1
    }
  ],
  "_score": 4.301029995663981,
  "_indexed": true,
  "_nocasepkg": "tin",
  "_universes": [
    "bioc"
  ],
  "_binaries": [
    {
      "r": "4.7.0",
      "os": "linux",
      "version": "1.45.0",
      "date": "2026-05-30T10:17:01.000Z",
      "distro": "noble",
      "commit": "9c84b8e0f2c467004f617c2dc6a0f917c7f4c5aa",
      "fileid": "77e9f371877e33d1abb3b243054ee270c57a9ae9d6724bc15a1dbdaf2eb6bad2",
      "status": "success",
      "check": "NOTE",
      "buildurl": "https://github.com/r-universe/bioc/actions/runs/26676723616"
    },
    {
      "r": "4.6.0",
      "os": "linux",
      "version": "1.45.0",
      "date": "2026-05-30T10:18:03.000Z",
      "distro": "noble",
      "commit": "9c84b8e0f2c467004f617c2dc6a0f917c7f4c5aa",
      "fileid": "7e911ac97236dcdd2617d4e3b3428dd5affe36c4e54fdb5483ff6dae52a0d5f8",
      "status": "success",
      "check": "NOTE",
      "buildurl": "https://github.com/r-universe/bioc/actions/runs/26676723616"
    },
    {
      "r": "4.5.3",
      "os": "mac",
      "version": "1.45.0",
      "date": "2026-05-30T14:24:59.000Z",
      "commit": "9c84b8e0f2c467004f617c2dc6a0f917c7f4c5aa",
      "fileid": "48db3fe52e5f4d5e009dfa8c610261ffb2eeee4433c98a2d5f805e5b75580907",
      "status": "success",
      "check": "NOTE",
      "buildurl": "https://github.com/r-universe/bioc/actions/runs/26676723616"
    },
    {
      "r": "4.6.0",
      "os": "mac",
      "version": "1.45.0",
      "date": "2026-05-30T14:25:23.000Z",
      "commit": "9c84b8e0f2c467004f617c2dc6a0f917c7f4c5aa",
      "fileid": "92f1e17d5791a973ba44b09f13f779b47169e00703f55745fd4387607d0bf9fb",
      "status": "success",
      "check": "NOTE",
      "buildurl": "https://github.com/r-universe/bioc/actions/runs/26676723616"
    },
    {
      "r": "4.6.0",
      "os": "wasm",
      "version": "1.45.0",
      "date": "2026-05-30T10:18:02.000Z",
      "commit": "9c84b8e0f2c467004f617c2dc6a0f917c7f4c5aa",
      "fileid": "a2129263bad970f99f275154fedb2dc325cadcc57aa3e6f0017d8af0c7c2f3d0",
      "status": "success",
      "buildurl": "https://github.com/r-universe/bioc/actions/runs/26676723616"
    },
    {
      "r": "4.7.0",
      "os": "win",
      "version": "1.45.0",
      "date": "2026-05-30T10:15:44.000Z",
      "commit": "9c84b8e0f2c467004f617c2dc6a0f917c7f4c5aa",
      "fileid": "fac479570643abc6fcdcc6e429b87c504df524f3607439ff13467f5cf91b13b0",
      "status": "success",
      "check": "NOTE",
      "buildurl": "https://github.com/r-universe/bioc/actions/runs/26676723616"
    },
    {
      "r": "4.5.3",
      "os": "win",
      "version": "1.45.0",
      "date": "2026-05-30T10:15:54.000Z",
      "commit": "9c84b8e0f2c467004f617c2dc6a0f917c7f4c5aa",
      "fileid": "6779dbb98180284301690db2c66ed233f017895e786e0f1500fa59f6cc09a5b6",
      "status": "success",
      "check": "NOTE",
      "buildurl": "https://github.com/r-universe/bioc/actions/runs/26676723616"
    },
    {
      "r": "4.6.0",
      "os": "win",
      "version": "1.45.0",
      "date": "2026-05-30T10:15:45.000Z",
      "commit": "9c84b8e0f2c467004f617c2dc6a0f917c7f4c5aa",
      "fileid": "cc70f43082d420ced783b6a9bda2ee90c0210263144fec0742ef49e273fcc72d",
      "status": "success",
      "check": "NOTE",
      "buildurl": "https://github.com/r-universe/bioc/actions/runs/26676723616"
    }
  ]
}