{ "_id": "6a13efaaacfb0bcc41d2ff6c", "Package": "ClusterJudge", "Type": "Package", "Title": "Judging Quality of Clustering Methods using Mutual Information", "Version": "1.35.0", "Date": "2022-02-06", "Author": "Adrian Pasculescu", "Maintainer": "Adrian Pasculescu ", "Description": "ClusterJudge implements the functions, examples and other\nsoftware published as an algorithm by Gibbons, FD and Roth FP.\nThe article is called \"Judging the Quality of Gene\nExpression-Based Clustering Methods Using Gene Annotation\" and\nit appeared in Genome Research, vol. 12, pp1574-1581 (2002).\nSee package?ClusterJudge for an overview.", "License": "Artistic-2.0", "biocViews": "Software, StatisticalMethod, Clustering, GeneExpression, GO", "LazyLoad": "yes", "LazyData": "yes", "VignetteBuilder": "knitr", "Config/pak/sysreqs": "libjpeg-dev libpng-dev libssl-dev", "Repository": "https://bioc.r-universe.dev", "Date/Publication": "2026-04-28 12:45:57 UTC", "RemoteUrl": "https://github.com/bioc/ClusterJudge", "RemoteRef": "HEAD", "RemoteSha": "cd1c2d96c27b64d127c20db99e66ff2b9c03caeb", "NeedsCompilation": "no", "Packaged": { "Date": "2026-05-25 06:38:00 UTC", "User": "root" }, "MD5sum": "70e046ab7cbb258befb56cf546cf8be6", "_user": "bioc", "_type": "src", "_file": "ClusterJudge_1.35.0.tar.gz", "_fileid": "c60d70e69235ce861f79e73f1e1e50a7e1ac25ababbfedfd8adbcaca550c7588", "_filesize": 1247369, "_sha256": "c60d70e69235ce861f79e73f1e1e50a7e1ac25ababbfedfd8adbcaca550c7588", "_created": "2026-05-25T06:38:00.000Z", "_published": "2026-05-25T06:43:54.149Z", "_jobs": [ { "job": 77667977751, "time": 164, "config": "bioc-checks", "r": "4.6.0", "check": "ERROR", "artifact": "7193021985" }, { "job": 77667977752, "time": 301, "config": "linux-devel-x86_64", "r": "4.7.0", "check": "OK", "artifact": "7193053589" }, { "job": 77667977823, "time": 293, "config": "linux-release-x86_64", "r": "4.6.0", "check": "OK", "artifact": "7193051913" }, { "job": 77667977763, "time": 157, "config": "macos-oldrel-arm64", "r": "4.5.3", "check": "OK", "artifact": "7193020029" }, { "job": 77667977760, "time": 173, "config": "macos-release-arm64", "r": "4.6.0", "check": "OK", "artifact": "7193024123" }, { "job": 77667532161, "time": 247, "config": "source", "r": "4.6.0", "check": "OK", "artifact": "7192980917" }, { "job": 77667977739, "time": 125, "config": "wasm-release", "r": "4.6.0", "check": "OK", "artifact": "7193012599" }, { "job": 77667977798, "time": 191, "config": "windows-devel", "r": "4.7.0", "check": "OK", "artifact": "7193028919" }, { "job": 77667977781, "time": 317, "config": "windows-oldrel", "r": "4.5.3", "check": "OK", "artifact": "7193057359" }, { "job": 77667977780, "time": 197, "config": "windows-release", "r": "4.6.0", "check": "OK", "artifact": "7193029955" } ], "_bioccheck": { "error": 1, "warning": 2, "note": 13 }, "_buildurl": "https://github.com/r-universe/bioc/actions/runs/26386950977", "_status": "success", "_host": "GitHub-Actions", "_upstream": "https://github.com/bioc/ClusterJudge", "_commit": { "id": "cd1c2d96c27b64d127c20db99e66ff2b9c03caeb", "author": "A Wokaty ", "committer": "A Wokaty ", "message": "bump x.y.z version to odd y following creation of RELEASE_3_23 branch\n", "time": 1777380357 }, "_maintainer": { "name": "Adrian Pasculescu", "email": "a.pasculescu@gmail.com", "login": "apasculescu", "description": "", "uuid": 63734368 }, "_distro": "noble", "_registered": true, "_dependencies": [ { "package": "R", "version": ">= 3.6", "role": "Depends" }, { "package": "stats", "role": "Depends" }, { "package": "utils", "role": "Depends" }, { "package": "graphics", "role": "Depends" }, { "package": "infotheo", "role": "Depends" }, { "package": "lattice", "role": "Depends" }, { "package": "latticeExtra", "role": "Depends" }, { "package": "httr", "role": "Depends" }, { "package": "jsonlite", "role": "Depends" }, { "package": "yeastExpData", "role": "Suggests" }, { "package": "knitr", "role": "Suggests" }, { "package": "rmarkdown", "role": "Suggests" }, { "package": "devtools", "role": "Suggests" }, { "package": "testthat", "role": "Suggests" }, { "package": "biomaRt", "role": "Suggests" } ], "_owner": "bioc", "_selfowned": true, "_usedby": 0, "_updates": [ { "week": "2025-44", "n": 2 }, { "week": "2026-18", "n": 2 } ], "_tags": [], "_bioc": [ { "branch": "devel", "version": "1.35.0", "bioc": "3.24" }, { "branch": "release", "version": "1.34.0", "bioc": "3.23" } ], "_topics": [ "software", "statisticalmethod", "clustering", "geneexpression", "go" ], "_userbio": { "uuid": 2286807, "type": "organization", "name": "Bioconductor", "description": "Software for the analysis and comprehension of high-throughput genomic data" }, "_downloads": { "count": 422, "source": "https://www.bioconductor.org/packages/stats/bioc/ClusterJudge" }, "_mentions": 1, "_searchresults": 3, "_rbuild": "4.6.0", "_assets": [ "extra/citation.cff", "extra/citation.html", "extra/citation.json", "extra/citation.txt", "extra/ClusterJudge.html", "extra/contents.json", "extra/NEWS.html", "extra/NEWS.txt", "manual.pdf" ], "_realowner": "bioc", "_cranurl": false, "_exports": [ "attribute_mut_inf", "clusterJudge", "clusterJudge_z_score", "consolidate_entity_attribute", "download_Yeast_GO_mapping", "download_Yeast_Go_terms", "entities_attribute_stats", "validate_association" ], "_datasets": [ { "name": "mi.GO.Yeast", "title": "precalculated mutual information between Gene Ontology attributes of Yeast genes", "object": "mi.GO.Yeast", "class": [ "matrix", "array" ], "fields": [ "GO:0000001", "GO:0000002", "GO:0000009", "GO:0000011", "GO:0000014", "GO:0000015", "GO:0000019", "GO:0000022", "GO:0000023", "GO:0000025", "GO:0000026", "GO:0000027", "GO:0000028", "GO:0000030", "GO:0000032", "GO:0000033", "GO:0000042", "GO:0000045", "GO:0000049", "GO:0000050", "GO:0000054", "GO:0000055", "GO:0000056", "GO:0000059", "GO:0000060", "GO:0000070", "GO:0000073", "GO:0000076", "GO:0000077", "GO:0000079", "GO:0000082", "GO:0000083", "GO:0000086", "GO:0000096", "GO:0000103", "GO:0000104", "GO:0000105", "GO:0000111", "GO:0000112", "GO:0000113", "GO:0000118", "GO:0000122", "GO:0000123", "GO:0000124", "GO:0000127", "GO:0000128", "GO:0000131", "GO:0000132", "GO:0000133", "GO:0000136", "GO:0000137", "GO:0000138", "GO:0000139", "GO:0000142", "GO:0000144", "GO:0000145", "GO:0000146", "GO:0000147", "GO:0000148", "GO:0000149", "GO:0000150", "GO:0000151", "GO:0000154", "GO:0000159", "GO:0000160", "GO:0000161", "GO:0000162", "GO:0000164", "GO:0000165", "GO:0000166", "GO:0000171", "GO:0000172", "GO:0000173", "GO:0000175", "GO:0000176", "GO:0000177", "GO:0000178", "GO:0000182", "GO:0000183", "GO:0000184", "GO:0000186", "GO:0000196", "GO:0000200", "GO:0000209", "GO:0000213", "GO:0000214", "GO:0000220", "GO:0000221", "GO:0000226", "GO:0000228", "GO:0000235", "GO:0000243", "GO:0000244", "GO:0000245", "GO:0000256", "GO:0000266", "GO:0000272", "GO:0000276", "GO:0000278", "GO:0000281", "GO:0000282", "GO:0000287", "GO:0000288", "GO:0000289", "GO:0000290", "GO:0000293", "GO:0000294", "GO:0000296", "GO:0000297", "GO:0000301", "GO:0000307", "GO:0000321", "GO:0000324", "GO:0000328", "GO:0000329", "GO:0000349", "GO:0000350", "GO:0000372", "GO:0000379", "GO:0000384", "GO:0000386", "GO:0000387", "GO:0000388", "GO:0000389", "GO:0000390", "GO:0000395", "GO:0000398", "GO:0000400", "GO:0000403", "GO:0000404", "GO:0000407", "GO:0000408", "GO:0000411", "GO:0000413", "GO:0000417", "GO:0000422", "GO:0000433", "GO:0000435", "GO:0000436", "GO:0000439", "GO:0000445", "GO:0000446", "GO:0000447", "GO:0000448", "GO:0000454", "GO:0000461", "GO:0000462", "GO:0000463", "GO:0000466", "GO:0000467", "GO:0000469", "GO:0000470", "GO:0000472", "GO:0000480", "GO:0000492", "GO:0000500", "GO:0000501", "GO:0000502", "GO:0000506", "GO:0000706", "GO:0000707", "GO:0000710", "GO:0000712", "GO:0000722", "GO:0000723", "GO:0000724", "GO:0000725", "GO:0000727", "GO:0000729", "GO:0000730", "GO:0000733", "GO:0000735", "GO:0000736", "GO:0000741", "GO:0000742", "GO:0000743", "GO:0000746", "GO:0000747", "GO:0000749", "GO:0000750", "GO:0000752", "GO:0000753", "GO:0000754", "GO:0000755", "GO:0000772", "GO:0000774", "GO:0000775", "GO:0000776", "GO:0000777", "GO:0000778", "GO:0000780", "GO:0000781", "GO:0000784", "GO:0000785", "GO:0000786", "GO:0000788", "GO:0000790", "GO:0000794", "GO:0000795", "GO:0000799", "GO:0000811", "GO:0000812", "GO:0000813", "GO:0000815", "GO:0000817", "GO:0000818", "GO:0000837", "GO:0000839", "GO:0000902", "GO:0000915", "GO:0000916", "GO:0000917", "GO:0000920", "GO:0000921", "GO:0000922", "GO:0000932", "GO:0000938", "GO:0000943", "GO:0000947", "GO:0000949", "GO:0000955", "GO:0000956", "GO:0000972", "GO:0000973", "GO:0000974", "GO:0000977", "GO:0000978", "GO:0000979", "GO:0000981", "GO:0000982", "GO:0000987", "GO:0000989", "GO:0000990", "GO:0000991", "GO:0000993", "GO:0000999", "GO:0001002", "GO:0001003", "GO:0001005", "GO:0001008", "GO:0001009", "GO:0001012", "GO:0001015", "GO:0001021", "GO:0001041", "GO:0001047", "GO:0001054", "GO:0001055", "GO:0001056", "GO:0001075", "GO:0001076", "GO:0001077", "GO:0001078", "GO:0001080", "GO:0001085", "GO:0001094", "GO:0001097", "GO:0001100", "GO:0001102", "GO:0001103", "GO:0001104", "GO:0001105", "GO:0001111", "GO:0001113", "GO:0001128", "GO:0001129", "GO:0001132", "GO:0001133", "GO:0001135", "GO:0001139", "GO:0001168", "GO:0001172", "GO:0001174", "GO:0001179", "GO:0001190", "GO:0001191", "GO:0001198", "GO:0001228", "GO:0001300", "GO:0001302", "GO:0001308", "GO:0001324", "GO:0001400", "GO:0001401", "GO:0001402", "GO:0001403", "GO:0001405", "GO:0001510", "GO:0001522", "GO:0001558", "GO:0001671", "GO:0001676", "GO:0001678", "GO:0001731", "GO:0001732", "GO:0001786", "GO:0001927", "GO:0001934", "GO:0002098", "GO:0002143", "GO:0002161", "GO:0002181", "GO:0002188", "GO:0002189", "GO:0002943", "GO:0003006", "GO:0003333", "GO:0003400", "GO:0003674", "GO:0003676", "GO:0003677", "GO:0003678", "GO:0003682", "GO:0003684", "GO:0003688", "GO:0003689", "GO:0003690", "GO:0003691", "GO:0003697", "GO:0003700", "GO:0003712", "GO:0003713", "GO:0003714", "GO:0003723", "GO:0003724", "GO:0003725", "GO:0003727", "GO:0003729", "GO:0003730", "GO:0003735", "GO:0003743", "GO:0003746", "GO:0003747", "GO:0003755", "GO:0003756", "GO:0003774", "GO:0003777", "GO:0003779", "GO:0003824", "GO:0003825", "GO:0003841", "GO:0003873", "GO:0003887", "GO:0003899", "GO:0003906", "GO:0003916", "GO:0003923", "GO:0003924", "GO:0003955", "GO:0003962", "GO:0003964", "GO:0003968", "GO:0003993", "GO:0004003", "GO:0004004", "GO:0004012", "GO:0004017", "GO:0004022", "GO:0004026", "GO:0004029", "GO:0004030", "GO:0004032", "GO:0004045", "GO:0004067", "GO:0004075", "GO:0004090", "GO:0004123", "GO:0004128", "GO:0004129", "GO:0004169", "GO:0004175", "GO:0004176", "GO:0004177", "GO:0004180", "GO:0004190", "GO:0004197", "GO:0004222", "GO:0004252", "GO:0004298", "GO:0004322", "GO:0004338", "GO:0004340", "GO:0004359", "GO:0004362", "GO:0004364", "GO:0004375", "GO:0004386", "GO:0004396", "GO:0004402", "GO:0004407", "GO:0004430", "GO:0004438", "GO:0004439", "GO:0004467", "GO:0004497", "GO:0004518", "GO:0004519", "GO:0004520", "GO:0004521", "GO:0004523", "GO:0004526", "GO:0004527", "GO:0004535", "GO:0004540", "GO:0004553", "GO:0004557", "GO:0004558", "GO:0004564", "GO:0004574", "GO:0004575", "GO:0004579", "GO:0004596", "GO:0004601", "GO:0004602", "GO:0004617", "GO:0004620", "GO:0004622", "GO:0004634", "GO:0004652", "GO:0004659", "GO:0004672", "GO:0004674", "GO:0004679", "GO:0004683", "GO:0004693", "GO:0004702", "GO:0004707", "GO:0004708", "GO:0004709", "GO:0004712", "GO:0004713", "GO:0004721", "GO:0004722", "GO:0004725", "GO:0004737", "GO:0004748", "GO:0004749", "GO:0004771", "GO:0004784", "GO:0004791", "GO:0004792", "GO:0004805", "GO:0004806", "GO:0004812", "GO:0004826", "GO:0004842", "GO:0004843", "GO:0004857", "GO:0004860", "GO:0004861", "GO:0004864", "GO:0004871", "GO:0004872", "GO:0004888", "GO:0005034", "GO:0005047", "GO:0005048", "GO:0005078", "GO:0005085", "GO:0005086", "GO:0005088", "GO:0005089", "GO:0005092", "GO:0005096", "GO:0005186", "GO:0005198", "GO:0005199", "GO:0005200", "GO:0005215", "GO:0005216", "GO:0005302", "GO:0005313", "GO:0005315", "GO:0005324", "GO:0005342", "GO:0005351", "GO:0005352", "GO:0005353", "GO:0005354", "GO:0005355", "GO:0005375", "GO:0005381", "GO:0005385", "GO:0005471", "GO:0005484", "GO:0005487", "GO:0005506", "GO:0005507", "GO:0005509", "GO:0005515", "GO:0005516", "GO:0005524", "GO:0005525", "GO:0005528", "GO:0005536", "GO:0005537", "GO:0005543", "GO:0005545", "GO:0005546", "GO:0005575", "GO:0005576", "GO:0005618", "GO:0005619", "GO:0005621", "GO:0005622", "GO:0005623", "GO:0005628", "GO:0005634", "GO:0005635", "GO:0005637", "GO:0005640", "GO:0005641", "GO:0005643", "GO:0005654", "GO:0005655", "GO:0005656", "GO:0005657", "GO:0005658", "GO:0005662", "GO:0005663", "GO:0005664", "GO:0005665", "GO:0005666", "GO:0005667", "GO:0005669", "GO:0005671", "GO:0005675", "GO:0005677", "GO:0005680", "GO:0005681", "GO:0005682", "GO:0005684", "GO:0005685", "GO:0005686", "GO:0005687", "GO:0005688", "GO:0005689", "GO:0005694", "GO:0005697", "GO:0005724", "GO:0005730", "GO:0005732", "GO:0005736", "GO:0005737", "GO:0005739", "GO:0005740", "GO:0005741", "GO:0005742", "GO:0005743", "GO:0005744", "GO:0005749", "GO:0005750", "GO:0005751", "GO:0005758", "GO:0005759", "GO:0005761", "GO:0005762", "GO:0005763", "GO:0005764", "GO:0005765", "GO:0005768", "GO:0005769", "GO:0005770", "GO:0005773", "GO:0005774", "GO:0005775", "GO:0005776", "GO:0005777", "GO:0005778", "GO:0005779", "GO:0005782", "GO:0005783", "GO:0005784", "GO:0005786", "GO:0005787", "GO:0005788", "GO:0005789", "GO:0005793", "GO:0005794", "GO:0005795", "GO:0005797", "GO:0005798", "GO:0005801", "GO:0005802", "GO:0005811", "GO:0005813", "GO:0005816", "GO:0005819", "GO:0005822", "GO:0005823", "GO:0005824", "GO:0005825", "GO:0005828", "GO:0005829", "GO:0005832", "GO:0005834", "GO:0005838", "GO:0005839", "GO:0005840", "GO:0005844", "GO:0005845", "GO:0005847", "GO:0005849", "GO:0005851", "GO:0005852", "GO:0005853", "GO:0005854", "GO:0005856", "GO:0005868", "GO:0005869", "GO:0005871", "GO:0005874", "GO:0005876", "GO:0005880", "GO:0005881", "GO:0005884", "GO:0005885", "GO:0005886", "GO:0005887", "GO:0005905", "GO:0005933", "GO:0005934", "GO:0005935", "GO:0005937", "GO:0005938", "GO:0005940", "GO:0005946", "GO:0005952", "GO:0005956", "GO:0005960", "GO:0005967", "GO:0005971", "GO:0005975", "GO:0005977", "GO:0005978", "GO:0005979", "GO:0005987", "GO:0005992", "GO:0005995", "GO:0006000", "GO:0006002", "GO:0006003", "GO:0006006", "GO:0006011", "GO:0006012", "GO:0006013", "GO:0006015", "GO:0006020", "GO:0006031", "GO:0006032", "GO:0006048", "GO:0006066", "GO:0006067", "GO:0006071", "GO:0006072", "GO:0006073", "GO:0006075", "GO:0006078", "GO:0006081", "GO:0006086", "GO:0006090", "GO:0006094", "GO:0006096", "GO:0006097", "GO:0006098", "GO:0006099", "GO:0006102", "GO:0006103", "GO:0006108", "GO:0006109", "GO:0006116", "GO:0006119", "GO:0006121", "GO:0006122", "GO:0006123", "GO:0006139", "GO:0006144", "GO:0006164", "GO:0006166", "GO:0006177", "GO:0006183", "GO:0006189", "GO:0006206", "GO:0006207", "GO:0006221", "GO:0006259", "GO:0006260", "GO:0006261", "GO:0006265", "GO:0006267", "GO:0006268", "GO:0006270", "GO:0006271", "GO:0006272", "GO:0006273", "GO:0006275", "GO:0006276", "GO:0006277", "GO:0006278", "GO:0006279", "GO:0006281", "GO:0006283", "GO:0006284", "GO:0006285", "GO:0006289", "GO:0006296", "GO:0006298", "GO:0006301", "GO:0006302", "GO:0006303", "GO:0006310", "GO:0006312", "GO:0006314", "GO:0006325", "GO:0006333", "GO:0006334", "GO:0006335", "GO:0006336", "GO:0006337", "GO:0006338", "GO:0006342", "GO:0006348", "GO:0006351", "GO:0006352", "GO:0006353", "GO:0006355", "GO:0006356", "GO:0006357", "GO:0006359", "GO:0006360", "GO:0006362", "GO:0006363", "GO:0006364", "GO:0006366", "GO:0006367", "GO:0006368", "GO:0006369", "GO:0006370", "GO:0006378", "GO:0006379", "GO:0006383", "GO:0006384", "GO:0006388", "GO:0006396", "GO:0006397", "GO:0006400", "GO:0006401", "GO:0006402", "GO:0006406", "GO:0006407", "GO:0006409", "GO:0006412", "GO:0006413", "GO:0006414", "GO:0006415", "GO:0006417", "GO:0006418", "GO:0006432", "GO:0006446", "GO:0006449", "GO:0006450", "GO:0006452", "GO:0006457", "GO:0006458", "GO:0006461", "GO:0006464", "GO:0006465", "GO:0006468", "GO:0006469", "GO:0006470", "GO:0006474", "GO:0006479", "GO:0006486", "GO:0006487", "GO:0006488", "GO:0006490", "GO:0006491", "GO:0006493", "GO:0006501", "GO:0006506", "GO:0006508", "GO:0006511", "GO:0006513", "GO:0006515", "GO:0006518", "GO:0006520", "GO:0006525", "GO:0006526", "GO:0006528", "GO:0006529", "GO:0006530", "GO:0006532", "GO:0006537", "GO:0006541", "GO:0006544", "GO:0006546", "GO:0006555", "GO:0006559", "GO:0006561", "GO:0006564", "GO:0006569", "GO:0006592", "GO:0006596", "GO:0006606", "GO:0006607", "GO:0006610", "GO:0006611", "GO:0006612", "GO:0006614", "GO:0006616", "GO:0006620", "GO:0006621", "GO:0006623", "GO:0006624", "GO:0006626", "GO:0006627", "GO:0006629", "GO:0006631", "GO:0006633", "GO:0006635", "GO:0006641", "GO:0006644", "GO:0006646", "GO:0006654", "GO:0006656", "GO:0006657", "GO:0006661", "GO:0006665", "GO:0006672", "GO:0006673", "GO:0006694", "GO:0006696", "GO:0006730", "GO:0006740", "GO:0006744", "GO:0006749", "GO:0006751", "GO:0006754", "GO:0006772", "GO:0006779", "GO:0006782", "GO:0006783", "GO:0006790", "GO:0006796", "GO:0006797", "GO:0006801", "GO:0006807", "GO:0006808", "GO:0006810", "GO:0006811", "GO:0006812", "GO:0006813", "GO:0006814", "GO:0006816", "GO:0006817", "GO:0006820", "GO:0006825", "GO:0006826", "GO:0006828", "GO:0006829", "GO:0006833", "GO:0006839", "GO:0006850", "GO:0006855", "GO:0006857", "GO:0006865", "GO:0006869", "GO:0006873", "GO:0006874", "GO:0006875", "GO:0006878", "GO:0006879", "GO:0006880", "GO:0006882", "GO:0006885", "GO:0006886", "GO:0006887", "GO:0006888", "GO:0006890", "GO:0006891", "GO:0006892", "GO:0006893", "GO:0006895", "GO:0006896", "GO:0006897", "GO:0006898", "GO:0006904", "GO:0006906", "GO:0006913", "GO:0006914", "GO:0006915", "GO:0006950", "GO:0006970", "GO:0006972", "GO:0006974", "GO:0006979", "GO:0006986", "GO:0006995", "GO:0006998", "GO:0006999", "GO:0007004", "GO:0007005", "GO:0007007", "GO:0007010", "GO:0007015", "GO:0007017", "GO:0007018", "GO:0007020", "GO:0007021", "GO:0007029", "GO:0007030", "GO:0007031", "GO:0007032", "GO:0007033", "GO:0007034", "GO:0007035", "GO:0007039", "GO:0007049", "GO:0007050", "GO:0007052", "GO:0007059", "GO:0007062", "GO:0007064", "GO:0007067", "GO:0007070", "GO:0007076", "GO:0007088", "GO:0007089", "GO:0007094", "GO:0007095", "GO:0007096", "GO:0007097", "GO:0007114", "GO:0007117", "GO:0007118", "GO:0007119", "GO:0007120", "GO:0007121", "GO:0007124", "GO:0007126", "GO:0007127", "GO:0007129", "GO:0007130", "GO:0007131", "GO:0007155", "GO:0007163", "GO:0007165", "GO:0007186", "GO:0007231", "GO:0007232", "GO:0007234", "GO:0007264", "GO:0007265", "GO:0007266", "GO:0007323", "GO:0007329", "GO:0007346", "GO:0007532", "GO:0007533", "GO:0007535", "GO:0008017", "GO:0008023", "GO:0008026", "GO:0008028", "GO:0008033", "GO:0008047", "GO:0008053", "GO:0008080", "GO:0008081", "GO:0008092", "GO:0008094", "GO:0008097", "GO:0008104", "GO:0008121", "GO:0008134", "GO:0008138", "GO:0008139", "GO:0008142", "GO:0008143", "GO:0008150", "GO:0008152", "GO:0008156", "GO:0008157", "GO:0008168", "GO:0008173", "GO:0008175", "GO:0008177", "GO:0008180", "GO:0008186", "GO:0008195", "GO:0008198", "GO:0008202", "GO:0008233", "GO:0008234", "GO:0008236", "GO:0008237", "GO:0008250", "GO:0008270", "GO:0008271", "GO:0008272", "GO:0008289", "GO:0008298", "GO:0008299", "GO:0008301", "GO:0008312", "GO:0008324", "GO:0008353", "GO:0008360", "GO:0008361", "GO:0008374", "GO:0008379", "GO:0008380", "GO:0008408", "GO:0008409", "GO:0008420", "GO:0008483", "GO:0008519", "GO:0008525", "GO:0008526", "GO:0008535", "GO:0008536", "GO:0008540", "GO:0008541", "GO:0008553", "GO:0008559", "GO:0008565", "GO:0008568", "GO:0008569", "GO:0008574", "GO:0008608", "GO:0008615", "GO:0008622", "GO:0008623", "GO:0008641", "GO:0008643", "GO:0008645", "GO:0008652", "GO:0008654", "GO:0008655", "GO:0008757", "GO:0008865", "GO:0009051", "GO:0009055", "GO:0009058", "GO:0009060", "GO:0009061", "GO:0009070", "GO:0009073", "GO:0009082", "GO:0009083", "GO:0009085", "GO:0009086", "GO:0009088", "GO:0009097", "GO:0009098", "GO:0009099", "GO:0009102", "GO:0009113", "GO:0009116", "GO:0009117", "GO:0009156", "GO:0009165", "GO:0009228", "GO:0009229", "GO:0009231", "GO:0009249", "GO:0009251", "GO:0009263", "GO:0009267", "GO:0009272", "GO:0009277", "GO:0009303", "GO:0009306", "GO:0009353", "GO:0009395", "GO:0009396", "GO:0009408", "GO:0009410", "GO:0009423", "GO:0009435", "GO:0009451", "GO:0009636", "GO:0009651", "GO:0009898", "GO:0009966", "GO:0009967", "GO:0009968", "GO:0009982", "GO:0009986", "GO:0009992", "GO:0010008", "GO:0010032", "GO:0010038", "GO:0010043", "GO:0010181", "GO:0010212", "GO:0010255", "GO:0010314", "GO:0010388", "GO:0010447", "GO:0010458", "GO:0010466", "GO:0010468", "GO:0010494", "GO:0010499", "GO:0010501", "GO:0010507", "GO:0010508", "GO:0010520", "GO:0010521", "GO:0010525", "GO:0010526", "GO:0010629", "GO:0010674", "GO:0010696", "GO:0010833", "GO:0010951", "GO:0010992", "GO:0010994", "GO:0012505", "GO:0012507", "GO:0015031", "GO:0015035", "GO:0015036", "GO:0015074", "GO:0015078", "GO:0015079", "GO:0015088", "GO:0015095", "GO:0015116", "GO:0015146", "GO:0015171", "GO:0015174", "GO:0015179", "GO:0015181", "GO:0015193", "GO:0015194", "GO:0015203", "GO:0015205", "GO:0015230", "GO:0015238", "GO:0015248", "GO:0015250", "GO:0015254", "GO:0015266", "GO:0015293", "GO:0015295", "GO:0015297", "GO:0015299", "GO:0015343", "GO:0015386", "GO:0015450", "GO:0015578", "GO:0015606", "GO:0015616", "GO:0015629", "GO:0015631", "GO:0015662", "GO:0015677", "GO:0015680", "GO:0015684", "GO:0015696", "GO:0015750", "GO:0015755", "GO:0015757", "GO:0015758", "GO:0015761", "GO:0015768", "GO:0015786", "GO:0015793", "GO:0015795", "GO:0015797", "GO:0015802", "GO:0015807", "GO:0015809", "GO:0015824", "GO:0015825", "GO:0015828", "GO:0015833", "GO:0015846", "GO:0015847", "GO:0015848", "GO:0015851", "GO:0015866", "GO:0015867", "GO:0015883", "GO:0015886", "GO:0015891", "GO:0015893", "GO:0015914", "GO:0015918", "GO:0015926", "GO:0015934", "GO:0015935", "GO:0015937", "GO:0015940", "GO:0015976", "GO:0015986", "GO:0015991", "GO:0015992", "GO:0016020", "GO:0016021", "GO:0016024", "GO:0016036", "GO:0016042", "GO:0016050", "GO:0016070", "GO:0016071", "GO:0016075", "GO:0016125", "GO:0016126", "GO:0016149", "GO:0016192", "GO:0016209", "GO:0016226", "GO:0016233", "GO:0016236", "GO:0016237", "GO:0016239", "GO:0016242", "GO:0016255", "GO:0016272", "GO:0016279", "GO:0016281", "GO:0016282", "GO:0016298", "GO:0016301", "GO:0016310", "GO:0016311", "GO:0016407", "GO:0016409", "GO:0016459", "GO:0016479", "GO:0016485", "GO:0016491", "GO:0016514", "GO:0016538", "GO:0016558", "GO:0016559", "GO:0016560", "GO:0016562", "GO:0016567", "GO:0016569", "GO:0016570", "GO:0016572", "GO:0016573", "GO:0016574", "GO:0016575", "GO:0016577", "GO:0016578", "GO:0016579", "GO:0016584", "GO:0016586", "GO:0016591", "GO:0016592", "GO:0016593", "GO:0016597", "GO:0016602", "GO:0016614", "GO:0016616", "GO:0016620", "GO:0016627", "GO:0016639", "GO:0016671", "GO:0016705", "GO:0016740", "GO:0016746", "GO:0016747", "GO:0016757", "GO:0016758", "GO:0016763", "GO:0016765", "GO:0016772", "GO:0016773", "GO:0016779", "GO:0016780", "GO:0016787", "GO:0016788", "GO:0016791", "GO:0016798", "GO:0016810", "GO:0016811", "GO:0016818", "GO:0016829", "GO:0016831", "GO:0016853", "GO:0016868", "GO:0016874", "GO:0016876", "GO:0016887", "GO:0016925", "GO:0016972", "GO:0016973", "GO:0017025", "GO:0017048", "GO:0017056", "GO:0017057", "GO:0017070", "GO:0017091", "GO:0017108", "GO:0017111", "GO:0017112", "GO:0017116", "GO:0017119", "GO:0017136", "GO:0017137", "GO:0017148", "GO:0017150", "GO:0017157", "GO:0017171", "GO:0017176", "GO:0017183", "GO:0017196", "GO:0018026", "GO:0018027", "GO:0018105", "GO:0018107", "GO:0018108", "GO:0018279", "GO:0018344", "GO:0018345", "GO:0018456", "GO:0019005", "GO:0019158", "GO:0019172", "GO:0019211", "GO:0019236", "GO:0019237", "GO:0019239", "GO:0019243", "GO:0019249", "GO:0019287", "GO:0019318", "GO:0019343", "GO:0019344", "GO:0019346", "GO:0019358", "GO:0019363", "GO:0019408", "GO:0019413", "GO:0019430", "GO:0019432", "GO:0019433", "GO:0019509", "GO:0019563", "GO:0019568", "GO:0019655", "GO:0019674", "GO:0019706", "GO:0019722", "GO:0019740", "GO:0019752", "GO:0019773", "GO:0019774", "GO:0019776", "GO:0019789", "GO:0019829", "GO:0019843", "GO:0019878", "GO:0019887", "GO:0019888", "GO:0019897", "GO:0019898", "GO:0019901", "GO:0019904", "GO:0019905", "GO:0019915", "GO:0019933", "GO:0020037", "GO:0022625", "GO:0022626", "GO:0022627", "GO:0022857", "GO:0022890", "GO:0022891", "GO:0022904", "GO:0023014", "GO:0030001", "GO:0030003", "GO:0030007", "GO:0030008", "GO:0030010", "GO:0030011", "GO:0030015", "GO:0030026", "GO:0030036", "GO:0030042", "GO:0030061", "GO:0030071", "GO:0030100", "GO:0030117", "GO:0030121", "GO:0030122", "GO:0030123", "GO:0030125", "GO:0030126", "GO:0030127", "GO:0030131", "GO:0030133", "GO:0030134", "GO:0030136", "GO:0030137", "GO:0030139", "GO:0030140", "GO:0030145", "GO:0030148", "GO:0030150", "GO:0030154", "GO:0030163", "GO:0030170", "GO:0030173", "GO:0030174", "GO:0030176", "GO:0030234", "GO:0030242", "GO:0030246", "GO:0030261", "GO:0030276", "GO:0030286", "GO:0030287", "GO:0030295", "GO:0030332", "GO:0030414", "GO:0030427", "GO:0030428", "GO:0030433", "GO:0030435", "GO:0030437", "GO:0030447", "GO:0030466", "GO:0030472", "GO:0030473", "GO:0030474", "GO:0030476", "GO:0030479", "GO:0030488", "GO:0030490", "GO:0030491", "GO:0030497", "GO:0030515", "GO:0030529", "GO:0030532", "GO:0030533", "GO:0030541", "GO:0030543", "GO:0030559", "GO:0030562", "GO:0030620", "GO:0030627", "GO:0030659", "GO:0030663", "GO:0030665", "GO:0030674", "GO:0030686", "GO:0030687", "GO:0030688", "GO:0030833", "GO:0030846", "GO:0030847", "GO:0030866", "GO:0030874", "GO:0030897", "GO:0030904", "GO:0030906", "GO:0030907", "GO:0030915", "GO:0030943", "GO:0030950", "GO:0030968", "GO:0030969", "GO:0030970", "GO:0030976", "GO:0030983", "GO:0031011", "GO:0031072", "GO:0031080", "GO:0031081", "GO:0031083", "GO:0031087", "GO:0031090", "GO:0031105", "GO:0031106", "GO:0031116", "GO:0031118", "GO:0031119", "GO:0031120", "GO:0031122", "GO:0031124", "GO:0031126", "GO:0031134", "GO:0031145", "GO:0031146", "GO:0031160", "GO:0031167", "GO:0031201", "GO:0031204", "GO:0031207", "GO:0031225", "GO:0031234", "GO:0031235", "GO:0031261", "GO:0031262", "GO:0031297", "GO:0031298", "GO:0031305", "GO:0031307", "GO:0031314", "GO:0031315", "GO:0031321", "GO:0031335", "GO:0031338", "GO:0031362", "GO:0031369", "GO:0031384", "GO:0031385", "GO:0031386", "GO:0031389", "GO:0031390", "GO:0031391", "GO:0031410", "GO:0031415", "GO:0031428", "GO:0031429", "GO:0031463", "GO:0031490", "GO:0031491", "GO:0031492", "GO:0031496", "GO:0031497", "GO:0031499", "GO:0031505", "GO:0031518", "GO:0031573", "GO:0031578", "GO:0031588", "GO:0031591", "GO:0031595", "GO:0031597", "GO:0031624", "GO:0031625", "GO:0031669", "GO:0031683", "GO:0031901", "GO:0031902", "GO:0031929", "GO:0031930", "GO:0031931", "GO:0031932", "GO:0031936", "GO:0031938", "GO:0031939", "GO:0031942", "GO:0031965", "GO:0031966", "GO:0031982", "GO:0031990", "GO:0032007", "GO:0032012", "GO:0032040", "GO:0032041", "GO:0032045", "GO:0032048", "GO:0032049", "GO:0032079", "GO:0032120", "GO:0032126", "GO:0032133", "GO:0032135", "GO:0032147", "GO:0032153", "GO:0032160", "GO:0032185", "GO:0032186", "GO:0032196", "GO:0032197", "GO:0032210", "GO:0032211", "GO:0032221", "GO:0032258", "GO:0032259", "GO:0032266", "GO:0032298", "GO:0032300", "GO:0032366", "GO:0032403", "GO:0032432", "GO:0032447", "GO:0032456", "GO:0032465", "GO:0032508", "GO:0032511", "GO:0032527", "GO:0032541", "GO:0032543", "GO:0032545", "GO:0032581", "GO:0032592", "GO:0032780", "GO:0032781", "GO:0032786", "GO:0032790", "GO:0032865", "GO:0032878", "GO:0032880", "GO:0032889", "GO:0032934", "GO:0032947", "GO:0032956", "GO:0032958", "GO:0032968", "GO:0032974", "GO:0032979", "GO:0033014", "GO:0033100", "GO:0033101", "GO:0033108", "GO:0033177", "GO:0033179", "GO:0033215", "GO:0033235", "GO:0033254", "GO:0033260", "GO:0033262", "GO:0033263", "GO:0033290", "GO:0033309", "GO:0033314", "GO:0033499", "GO:0033551", "GO:0033553", "GO:0033573", "GO:0033588", "GO:0033597", "GO:0033615", "GO:0033617", "GO:0033698", "GO:0033962", "GO:0034044", "GO:0034045", "GO:0034063", "GO:0034087", "GO:0034219", "GO:0034220", "GO:0034221", "GO:0034227", "GO:0034247", "GO:0034271", "GO:0034272", "GO:0034314", "GO:0034316", "GO:0034337", "GO:0034354", "GO:0034356", "GO:0034388", "GO:0034389", "GO:0034398", "GO:0034399", "GO:0034427", "GO:0034448", "GO:0034450", "GO:0034455", "GO:0034456", "GO:0034473", "GO:0034475", "GO:0034476", "GO:0034497", "GO:0034498", "GO:0034501", "GO:0034503", "GO:0034508", "GO:0034511", "GO:0034513", "GO:0034515", "GO:0034517", "GO:0034551", "GO:0034553", "GO:0034599", "GO:0034605", "GO:0034613", "GO:0034629", "GO:0034657", "GO:0034727", "GO:0034729", "GO:0034755", "GO:0034965", "GO:0034967", "GO:0034975", "GO:0034976", "GO:0034990", "GO:0035023", "GO:0035024", "GO:0035064", "GO:0035066", "GO:0035091", "GO:0035267", "GO:0035269", "GO:0035308", "GO:0035327", "GO:0035335", "GO:0035339", "GO:0035350", "GO:0035361", "GO:0035376", "GO:0035392", "GO:0035428", "GO:0035434", "GO:0035524", "GO:0035542", "GO:0035556", "GO:0035621", "GO:0035690", "GO:0035725", "GO:0035753", "GO:0035786", "GO:0035859", "GO:0035861", "GO:0035948", "GO:0035969", "GO:0035974", "GO:0035999", "GO:0036002", "GO:0036003", "GO:0036008", "GO:0036010", "GO:0036092", "GO:0036095", "GO:0036205", "GO:0036228", "GO:0036267", "GO:0036297", "GO:0036381", "GO:0036402", "GO:0036459", "GO:0036464", "GO:0038203", "GO:0040001", "GO:0040020", "GO:0042026", "GO:0042124", "GO:0042134", "GO:0042138", "GO:0042144", "GO:0042147", "GO:0042148", "GO:0042149", "GO:0042162", "GO:0042171", "GO:0042175", "GO:0042176", "GO:0042254", "GO:0042255", "GO:0042256", "GO:0042273", "GO:0042274", "GO:0042276", "GO:0042277", "GO:0042391", "GO:0042393", "GO:0042406", "GO:0042407", "GO:0042493", "GO:0042542", "GO:0042555", "GO:0042578", "GO:0042597", "GO:0042623", "GO:0042626", "GO:0042645", "GO:0042719", "GO:0042721", "GO:0042729", "GO:0042759", "GO:0042761", "GO:0042765", "GO:0042766", "GO:0042787", "GO:0042788", "GO:0042790", "GO:0042791", "GO:0042797", "GO:0042800", "GO:0042802", "GO:0042803", "GO:0042819", "GO:0042823", "GO:0042826", "GO:0042843", "GO:0042908", "GO:0042973", "GO:0042991", "GO:0043001", "GO:0043007", "GO:0043021", "GO:0043022", "GO:0043023", "GO:0043024", "GO:0043039", "GO:0043044", "GO:0043047", "GO:0043066", "GO:0043085", "GO:0043086", "GO:0043087", "GO:0043111", "GO:0043130", "GO:0043137", "GO:0043138", "GO:0043140", "GO:0043141", "GO:0043142", "GO:0043161", "GO:0043162", "GO:0043169", "GO:0043171", "GO:0043231", "GO:0043248", "GO:0043254", "GO:0043328", "GO:0043332", "GO:0043433", "GO:0043457", "GO:0043486", "GO:0043488", "GO:0043495", "GO:0043505", "GO:0043547", "GO:0043565", "GO:0043570", "GO:0043596", "GO:0043614", "GO:0043618", "GO:0043619", "GO:0043628", "GO:0043629", "GO:0043666", "GO:0043813", "GO:0043928", "GO:0043935", "GO:0043966", "GO:0043967", "GO:0044183", "GO:0044205", "GO:0044206", "GO:0044212", "GO:0044237", "GO:0044249", "GO:0044255", "GO:0044257", "GO:0044262", "GO:0044284", "GO:0044376", "GO:0044611", "GO:0044613", "GO:0044614", "GO:0044615", "GO:0044695", "GO:0044697", "GO:0044718", "GO:0044732", "GO:0044774", "GO:0044805", "GO:0044822", "GO:0044879", "GO:0045002", "GO:0045010", "GO:0045033", "GO:0045039", "GO:0045040", "GO:0045041", "GO:0045047", "GO:0045048", "GO:0045053", "GO:0045116", "GO:0045121", "GO:0045128", "GO:0045132", "GO:0045141", "GO:0045143", "GO:0045144", "GO:0045182", "GO:0045184", "GO:0045261", "GO:0045263", "GO:0045292", "GO:0045324", "GO:0045332", "GO:0045333", "GO:0045454", "GO:0045719", "GO:0045721", "GO:0045722", "GO:0045727", "GO:0045732", "GO:0045737", "GO:0045807", "GO:0045835", "GO:0045859", "GO:0045860", "GO:0045892", "GO:0045893", "GO:0045899", "GO:0045901", "GO:0045903", "GO:0045910", "GO:0045943", "GO:0045944", "GO:0045947", "GO:0045948", "GO:0046020", "GO:0046034", "GO:0046323", "GO:0046352", "GO:0046488", "GO:0046513", "GO:0046523", "GO:0046540", "GO:0046580", "GO:0046618", "GO:0046654", "GO:0046656", "GO:0046658", "GO:0046677", "GO:0046685", "GO:0046686", "GO:0046688", "GO:0046695", "GO:0046777", "GO:0046835", "GO:0046854", "GO:0046856", "GO:0046872", "GO:0046873", "GO:0046898", "GO:0046907", "GO:0046912", "GO:0046933", "GO:0046939", "GO:0046961", "GO:0046982", "GO:0046983", "GO:0047372", "GO:0047429", "GO:0047433", "GO:0048017", "GO:0048027", "GO:0048037", "GO:0048039", "GO:0048188", "GO:0048193", "GO:0048194", "GO:0048255", "GO:0048278", "GO:0048279", "GO:0048280", "GO:0048309", "GO:0048313", "GO:0048471", "GO:0048478", "GO:0048500", "GO:0050072", "GO:0050291", "GO:0050660", "GO:0050661", "GO:0050662", "GO:0050790", "GO:0050821", "GO:0051010", "GO:0051015", "GO:0051016", "GO:0051017", "GO:0051020", "GO:0051028", "GO:0051082", "GO:0051083", "GO:0051087", "GO:0051117", "GO:0051123", "GO:0051131", "GO:0051156", "GO:0051213", "GO:0051228", "GO:0051233", "GO:0051260", "GO:0051276", "GO:0051286", "GO:0051287", "GO:0051292", "GO:0051301", "GO:0051307", "GO:0051315", "GO:0051321", "GO:0051377", "GO:0051382", "GO:0051453", "GO:0051457", "GO:0051536", "GO:0051537", "GO:0051539", "GO:0051568", "GO:0051598", "GO:0051601", "GO:0051603", "GO:0051604", "GO:0051607", "GO:0051646", "GO:0051654", "GO:0051666", "GO:0051726", "GO:0051787", "GO:0051865", "GO:0051880", "GO:0051920", "GO:0051974", "GO:0051987", "GO:0052689", "GO:0052851", "GO:0055072", "GO:0055085", "GO:0055087", "GO:0055088", "GO:0055114", "GO:0055129", "GO:0060188", "GO:0060195", "GO:0060211", "GO:0060237", "GO:0060261", "GO:0060303", "GO:0060304", "GO:0060627", "GO:0060963", "GO:0061025", "GO:0061077", "GO:0061088", "GO:0061186", "GO:0061188", "GO:0061393", "GO:0061395", "GO:0061402", "GO:0061404", "GO:0061408", "GO:0061410", "GO:0061412", "GO:0061414", "GO:0061429", "GO:0061587", "GO:0061617", "GO:0061630", "GO:0061709", "GO:0070006", "GO:0070034", "GO:0070056", "GO:0070058", "GO:0070072", "GO:0070086", "GO:0070096", "GO:0070124", "GO:0070125", "GO:0070126", "GO:0070131", "GO:0070180", "GO:0070181", "GO:0070209", "GO:0070210", "GO:0070250", "GO:0070262", "GO:0070273", "GO:0070300", "GO:0070301", "GO:0070336", "GO:0070390", "GO:0070403", "GO:0070413", "GO:0070417", "GO:0070469", "GO:0070475", "GO:0070478", "GO:0070481", "GO:0070491", "GO:0070525", "GO:0070534", "GO:0070550", "GO:0070573", "GO:0070577", "GO:0070588", "GO:0070628", "GO:0070649", "GO:0070651", "GO:0070676", "GO:0070682", "GO:0070772", "GO:0070814", "GO:0070816", "GO:0070822", "GO:0070847", "GO:0070860", "GO:0070868", "GO:0070880", "GO:0070898", "GO:0070911", "GO:0070932", "GO:0070940", "GO:0070941", "GO:0070966", "GO:0070973", "GO:0070987", "GO:0071004", "GO:0071006", "GO:0071007", "GO:0071008", "GO:0071011", "GO:0071013", "GO:0071028", "GO:0071031", "GO:0071033", "GO:0071034", "GO:0071035", "GO:0071036", "GO:0071037", "GO:0071038", "GO:0071039", "GO:0071042", "GO:0071049", "GO:0071051", "GO:0071169", "GO:0071230", "GO:0071266", "GO:0071361", "GO:0071400", "GO:0071406", "GO:0071421", "GO:0071432", "GO:0071459", "GO:0071465", "GO:0071469", "GO:0071470", "GO:0071472", "GO:0071555", "GO:0071561", "GO:0071577", "GO:0071627", "GO:0071629", "GO:0071630", "GO:0071704", "GO:0071712", "GO:0071782", "GO:0071786", "GO:0071805", "GO:0071806", "GO:0071819", "GO:0071897", "GO:0071901", "GO:0071930", "GO:0071931", "GO:0071944", "GO:0071949", "GO:0071970", "GO:0072344", "GO:0072363", "GO:0072380", "GO:0072488", "GO:0072546", "GO:0072593", "GO:0072686", "GO:0072687", "GO:0080025", "GO:0080130", "GO:0080182", "GO:0089709", "GO:0089711", "GO:0090002", "GO:0090156", "GO:0090158", "GO:0090262", "GO:0090282", "GO:0090305", "GO:0090307", "GO:0090337", "GO:0090338", "GO:0090501", "GO:0090502", "GO:0090503", "GO:0090522", "GO:0090630", "GO:0097002", "GO:0097027", "GO:0097033", "GO:0097034", "GO:0097038", "GO:0097042", "GO:0097196", "GO:0097255", "GO:0097271", "GO:0097428", "GO:0097466", "GO:0097502", "GO:0097550", "GO:0097552", "GO:0097582", "GO:0098655", "GO:0098789", "GO:0098869", "GO:0099022", "GO:0099131", "GO:0099132", "GO:0102391", "GO:1900101", "GO:1900153", "GO:1900182", "GO:1900436", "GO:1900461", "GO:1901409", "GO:1901673", "GO:1901800", "GO:1901925", "GO:1902047", "GO:1902275", "GO:1902358", "GO:1902475", "GO:1902476", "GO:1902600", "GO:1902626", "GO:1903507", "GO:1903600", "GO:1903710", "GO:1903711", "GO:1903825", "GO:1903826", "GO:1903830", "GO:1903833", "GO:1903874", "GO:1904263", "GO:1904659", "GO:1904668", "GO:1904669", "GO:1990022", "GO:1990070", "GO:1990071", "GO:1990072", "GO:1990112", "GO:1990116", "GO:1990143", "GO:1990269", "GO:1990316", "GO:1990415", "GO:1990429", "GO:1990456", "GO:1990467", "GO:1990468", "GO:1990481", "GO:1990683", "GO:1990726", "GO:1990758", "GO:1990816", "GO:1990822", "GO:1990841", "GO:2000185", "GO:2000218", "GO:2000219", "GO:2000220", "GO:2000221", "GO:2000222", "GO:2000251", "GO:2001165", "GO:2001173", "GO:2001209" ], "rows": 2266, "table": true, "tojson": true }, { "name": "Yeast.GO.assocs", "title": "Gene Ontology attributes associated to Yeast Gene entities", "object": "Yeast.GO.assocs", "class": [ "data.frame" ], "fields": [ "SGDID", "GOID" ], "rows": 70487, "table": true, "tojson": true } ], "_help": [ { "page": "ClusterJudge-package", "title": "Judging Quality of Clustering Methods using Mutual Information", "topics": [ "ClusterJudge-package", "ClusterJudge" ] }, { "page": "attribute_mut_inf", "title": "calculates the mutual information between each attribute of the entity.attribute pairs", "topics": [ "attribute_mut_inf" ] }, { "page": "clusterJudge", "title": "judges clustering using an entity.attribute table", "topics": [ "clusterJudge" ] }, { "page": "clusterJudge_z_score", "title": "calculates the `cluster judge` z-score", "topics": [ "clusterJudge_z_score" ] }, { "page": "consolidate_entity_attribute", "title": "removes the redundant attributes based on the mutual information between attributes", "topics": [ "consolidate_entity_attribute" ] }, { "page": "download_Yeast_GO_mapping", "title": "downloads the Gene Ontology attributes mapped to Yeast genes", "topics": [ "download_Yeast_GO_mapping" ] }, { "page": "download_Yeast_Go_terms", "title": "downloads the description of Gene Ontology attributes", "topics": [ "download_Yeast_Go_terms" ] }, { "page": "entities_attribute_stats", "title": "presents basic statistics on the number of entities per attribute", "topics": [ "entities_attribute_stats" ] }, { "page": "mi.GO.Yeast", "title": "precalculated mutual information between Gene Ontology attributes of Yeast genes", "topics": [ "mi.GO.Yeast" ] }, { "page": "validate_association", "title": "validates the associations between entities and attributes", "topics": [ "validate_association" ] }, { "page": "Yeast.GO.assocs", "title": "Gene Ontology attributes associated to Yeast Gene entities", "topics": [ "Yeast.GO.assocs" ] } ], "_rundeps": [ "askpass", "curl", "deldir", "httr", "infotheo", "interp", "jpeg", "jsonlite", "lattice", "latticeExtra", "MASS", "mime", "openssl", "png", "R6", "RColorBrewer", "Rcpp", "RcppEigen", "sys" ], "_vignettes": [ { "source": "ClusterJudge-intro.Rmd", "filename": "ClusterJudge-intro.html", "title": "ClusterJudge", "author": "Adrian Pasculescu", "engine": "knitr::rmarkdown", "headings": [ "Introduction", "Obtaining the clustering", "Obtaining Entity Attribute associations", "Consolidating Entity-Attribute associations", "Calculating the mutual information", "Judging the clustering for selected uncertainty levels", "References" ], "created": "2017-06-14 18:49:12", "modified": "2019-04-17 17:53:56", "commits": 6 } ], "_score": 3.3010299956639813, "_indexed": true, "_nocasepkg": "clusterjudge", "_universes": [ "bioc", "apasculescu" ], "_binaries": [ { "r": "4.7.0", "os": "linux", "version": "1.35.0", "date": "2026-05-25T06:41:34.000Z", "distro": "noble", "commit": "cd1c2d96c27b64d127c20db99e66ff2b9c03caeb", "fileid": "2028847ab4f01e90d8b1dac6e11f84b2915e50018707f874b4b3182117330d15", "status": "success", "check": "OK", "buildurl": "https://github.com/r-universe/bioc/actions/runs/26386950977" }, { "r": "4.6.0", "os": "linux", "version": "1.35.0", "date": "2026-05-25T06:41:25.000Z", "distro": "noble", "commit": "cd1c2d96c27b64d127c20db99e66ff2b9c03caeb", "fileid": "5aee829ba5db5de64a1e2d5c1c34e80c311412f64d0829cd69963ff3f82a05f6", "status": "success", "check": "OK", "buildurl": "https://github.com/r-universe/bioc/actions/runs/26386950977" }, { "r": "4.5.3", "os": "mac", "version": "1.35.0", "date": "2026-05-25T06:39:38.000Z", "commit": "cd1c2d96c27b64d127c20db99e66ff2b9c03caeb", "fileid": "636432238c21ca4920c54edc36d21f84a79224a9bab6a4527d64adcca7be70fa", "status": "success", "check": "OK", "buildurl": "https://github.com/r-universe/bioc/actions/runs/26386950977" }, { "r": "4.6.0", "os": "mac", "version": "1.35.0", "date": "2026-05-25T06:39:42.000Z", "commit": "cd1c2d96c27b64d127c20db99e66ff2b9c03caeb", "fileid": "ace7477484b2ffb36c4291c0826c7d1e4347ebb35cd7841934912809357f2ac7", "status": "success", "check": "OK", "buildurl": "https://github.com/r-universe/bioc/actions/runs/26386950977" }, { "r": "4.6.0", "os": "wasm", "version": "1.35.0", "date": "2026-05-25T06:40:21.000Z", "commit": "cd1c2d96c27b64d127c20db99e66ff2b9c03caeb", "fileid": "5ade07009b1d587231a3d0871c6b6da747269f5e74409931a92c74d88302f258", "status": "success", "buildurl": "https://github.com/r-universe/bioc/actions/runs/26386950977" }, { "r": "4.7.0", "os": "win", "version": "1.35.0", "date": "2026-05-25T06:39:51.000Z", "commit": "cd1c2d96c27b64d127c20db99e66ff2b9c03caeb", "fileid": "654af3cafa323a946a0cd6665dcede4c09510fa04ea0a14d41124db0ad9c6441", "status": "success", "check": "OK", "buildurl": "https://github.com/r-universe/bioc/actions/runs/26386950977" }, { "r": "4.5.3", "os": "win", "version": "1.35.0", "date": "2026-05-25T06:41:28.000Z", "commit": "cd1c2d96c27b64d127c20db99e66ff2b9c03caeb", "fileid": "db95d08390a79ed250dbb4085b1f16962dc7fa32b6374ab2063a34800bd06674", "status": "success", "check": "OK", "buildurl": "https://github.com/r-universe/bioc/actions/runs/26386950977" }, { "r": "4.6.0", "os": "win", "version": "1.35.0", "date": "2026-05-25T06:39:42.000Z", "commit": "cd1c2d96c27b64d127c20db99e66ff2b9c03caeb", "fileid": "eb006aa86c040e979cc46baa6b27393dc01819fdb17da996b33a3b020caf67dc", "status": "success", "check": "OK", "buildurl": "https://github.com/r-universe/bioc/actions/runs/26386950977" } ] }